1.相同點 (1)系統目標一致。
兩者都對企業的經濟業務進行記錄和核算，最終目標都是為了加強經營管理，提供會計資訊，參與經營決策，提高企業經濟效益。
(2)採用的基本會計理論與方法一致。
兩系統都要遵循基本的會計理論和方法，都採用複式記賬原理。
(3)都要遵守會計和財務制度，以及國家的各項財經法紀，嚴格貫徹執行會計法規，從措施、技術、制度上堵塞各種可能的漏洞，消除弊端，防止作弊。
(4)系統的基本功能相同。
任何一個資訊要達到系統目標，都應具備資訊的採集輸入、存貯、加工處理、傳輸和輸出這五項功能。
(5)都要儲存會計檔案。
作為會計資訊系統的輸出，會計資訊檔案必須妥善儲存，以便查詢。
(6)編制會計報表的要求相同。
兩系統都要編制會計報表，並且都必須按國家要求編制企業外部報表。
2.主要差異比較 (1)系統初始化設定工作有差異。
手工會計的初始化工作包括建立會計科目，開設總賬，登入餘額等；會計電算化的初始化設定工作則較為複雜，且帶有一定的難度，其內容主要有會計系統的安裝，賬套的設定，網路使用者的許可權設定，操作員及許可權的設定，軟體執行環境的設定，科目級別與位長的設定，會計科目及其程式碼的建立，最明細科目初始餘額的輸入，憑證型別設定，自動轉賬分錄定義，會計報表名稱、格式、資料來源公式的定義等。
(2)科目的設定和使用上存在差異。
在手工會計中，由於手工核算的限制，將賬戶分設為總賬和明細賬，明細賬大多僅設到三級賬戶，此外，再開設輔助賬戶以滿足管理核算上的需要；科目的設定和使用一般都僅為中文科目。
而在會計電算化中，計算機可以處理各種複雜的工作，科目的級數和位長設定因不同的軟體而異，有的財務軟體將科目的級崐數可設定到6級以上，完全滿足了會計明細核算方面的需要；科目的設定上除設定中文科目外，仍應設定與中文科目一一對應的科目程式碼，使用科目時，計算機只要求使用者輸入某一科目程式碼，而不要求輸入該中文科目，但在顯示列印時，一般都將中文科目和與之對應的科目代崐碼同時顯示。
(3)賬務處理程式上存在差異。
手工會計根據企業的生產規模、經營方式和管理形式的不同，採用不同的會計核算形式，常用的賬務處理程式有記賬憑證核算形式、科目彙總表核算形式、彙總記賬憑證核算形式、日記賬核算形式等，對業務資料採用了分散收集、分散處理、重複登記的操作方法，透過多人員、多環節進行內部牽制和相互核對，目的是為了簡化會計核算的手續，以減少舞弊和差錯。
而在會計電算化中，一般要根據檔案的設定來確定，常用的是日記賬檔案核算形式和憑證檔案核算形式，在一個計算機會計系統中，通常只採用其中一種核算形式，對資料進行集中收集、統一處理、資料共享的操作方法。
(4)賬簿格式存在差異。
在手工會計中，賬簿的格式分為訂本式、活頁式和卡片式三種,並且對現金日記賬、銀行存款日記賬和總賬必須採用訂本式賬簿。
而在計算機會計系統中,由於受到印表機的條件限制,不太可能打印出訂本式賬簿,因此根據《會計電算化工作規範》規定,所有的賬頁均可按活頁式列印後裝訂成冊;總賬賬頁的格式有傳統三欄借貸式總賬和科目彙總式總賬,後者可代替前者;明細賬的格式可有三欄式、多欄式和數量金額式等。
1.相同點 (1)系統目標一致。
兩者都對企業的經濟業務進行記錄和核算，最終目標都是為了加強經營管理，提供會計資訊，參與經營決策，提高企業經濟效益。
(2)採用的基本會計理論與方法一致。
兩系統都要遵循基本的會計理論和方法，都採用複式記賬原理。
(3)都要遵守會計和財務制度，以及國家的各項財經法紀，嚴格貫徹執行會計法規，從措施、技術、制度上堵塞各種可能的漏洞，消除弊端，防止作弊。
(4)系統的基本功能相同。
任何一個資訊要達到系統目標，都應具備資訊的採集輸入、存貯、加工處理、傳輸和輸出這五項功能。
(5)都要儲存會計檔案。
作為會計資訊系統的輸出，會計資訊檔案必須妥善儲存，以便查詢。
(6)編制會計報表的要求相同。
兩系統都要編制會計報表，並且都必須按國家要求編制企業外部報表。
2.主要差異比較 (1)系統初始化設定工作有差異。
手工會計的初始化工作包括建立會計科目，開設總賬，登入餘額等；會計電算化的初始化設定工作則較為複雜，且帶有一定的難度，其內容主要有會計系統的安裝，賬套的設定，網路使用者的許可權設定，操作員及許可權的設定，軟體執行環境的設定，科目級別與位長的設定，會計科目及其程式碼的建立，最明細科目初始餘額的輸入，憑證型別設定，自動轉賬分錄定義，會計報表名稱、格式、資料來源公式的定義等。
(2)科目的設定和使用上存在差異。
在手工會計中，由於手工核算的限制，將賬戶分設為總賬和明細賬，明細賬大多僅設到三級賬戶，此外，再開設輔助賬戶以滿足管理核算上的需要；科目的設定和使用一般都僅為中文科目。
而在會計電算化中，計算機可以處理各種複雜的工作，科目的級數和位長設定因不同的軟體而異，有的財務軟體將科目的級崐數可設定到6級以上，完全滿足了會計明細核算方面的需要；科目的設定上除設定中文科目外，仍應設定與中文科目一一對應的科目程式碼，使用科目時，計算機只要求使用者輸入某一科目程式碼，而不要求輸入該中文科目，但在顯示列印時，一般都將中文科目和與之對應的科目代崐碼同時顯示。
(3)賬務處理程式上存在差異。
手工會計根據企業的生產規模、經營方式和管理形式的不同，採用不同的會計核算形式，常用的賬務處理程式有記賬憑證核算形式、科目彙總表核算形式、彙總記賬憑證核算形式、日記賬核算形式等，對業務資料採用了分散收集、分散處理、重複登記的操作方法，透過多人員、多環節進行內部牽制和相互核對，目的是為了簡化會計核算的手續，以減少舞弊和差錯。
而在會計電算化中，一般要根據檔案的設定來確定，常用的是日記賬檔案核算形式和憑證檔案核算形式，在一個計算機會計系統中，通常只採用其中一種核算形式，對資料進行集中收集、統一處理、資料共享的操作方法。
(4)賬簿格式存在差異。
在手工會計中，賬簿的格式分為訂本式、活頁式和卡片式三種,並且對現金日記賬、銀行存款日記賬和總賬必須採用訂本式賬簿。
而在計算機會計系統中,由於受到印表機的條件限制,不太可能打印出訂本式賬簿,因此根據《會計電算化工作規範》規定,所有的賬頁均可按活頁式列印後裝訂成冊;總賬賬頁的格式有傳統三欄借貸式總賬和科目彙總式總賬,後者可代替前者;明細賬的格式可有三欄式、多欄式和數量金額式等。