1、墨水的顆粒大小不同
染料墨水中的染料著色劑是以單分子方式完全溶解在墨水中，其著色劑顆粒小，易溶解於水或其他化學溶劑。染料墨水的染料著色劑存在有大量的親水粒子，易溶解。染料墨水是分子級全溶解的墨水，一般直徑是1~2奈米。
顏料墨水是由粒子組成的分散體，它的最小粒徑要比染料墨水的分子直徑大得多，為奈米至微米不等。用於製造顏料墨水的顏料粒徑分為奈米級和微米級，其中奈米級粒徑平均（LD50)在40-125奈米，最大粒徑（LD90)不得超過180奈米，微米級粒徑在0.125-0.300微米。
2、水溶性不同
染料墨水一般是水溶性墨水；顏料墨水是不溶於水的，所以需要超細分散後才能適用。
3、防水效能不同
染料墨水的染料著色劑存在有大量的親水粒子，易溶解。這樣一旦列印稿遇水，原先在介質上固定好的著色劑將再次溶解，並隨著水的流動向四周擴散，造成嚴重的暈染現象。
顏料墨水由於顏料不溶於水，在列印紙張遇到水分時耐水性較強。
4、化學效能不同
染料墨水的著色劑直接暴露在空氣中，在光線和臭氧等的作用下，染料著色劑的化學鏈可能斷裂，造成著色劑變色等現象，使列印稿褪色，從而影響其儲存效能。
顏料墨水的化學穩定性和光學穩定性好，耐水性和耐光性好，安全性高，列印顏色銳度和密度高。較大的顏料聚集體受到紫外線和臭氧作用時，僅僅表面層被破壞，內層的著色劑仍保持其顏色特性，因此有較高的耐光耐氣候牢度。
5、使用時噴頭堵塞情況不同
顏料墨水顆粒大，很容易造成堵頭，列印的圖象色澤不好，不鮮豔。
染料墨水不易發生堵塞噴頭的現象，即便是堵塞，疏通噴頭也較為簡單。
6、使用效果不同
顏料墨水噴繪後易於被材料吸收，並且列印在平整光滑的紙張上，對光的放射表現很好，因此色彩還原的能力比較強，打印出來的圖象色彩豔麗。
但由於染料墨水不像顏料墨水一樣表面有一層聚合物的保護，因此在在惡劣的條件下，分子容易分解，造成褪色。
7、顯色原理不同
染料墨水滲入到介質分子隙間沉澱後再形成色彩；顏料墨水是透過著色劑(顏料)以物理形式（使用高分子聚合物為粘合劑）附著在介質表面（如影印紙或列印材料等）後顯色的。
1、墨水的顆粒大小不同
染料墨水中的染料著色劑是以單分子方式完全溶解在墨水中，其著色劑顆粒小，易溶解於水或其他化學溶劑。染料墨水的染料著色劑存在有大量的親水粒子，易溶解。染料墨水是分子級全溶解的墨水，一般直徑是1~2奈米。
顏料墨水是由粒子組成的分散體，它的最小粒徑要比染料墨水的分子直徑大得多，為奈米至微米不等。用於製造顏料墨水的顏料粒徑分為奈米級和微米級，其中奈米級粒徑平均（LD50)在40-125奈米，最大粒徑（LD90)不得超過180奈米，微米級粒徑在0.125-0.300微米。
2、水溶性不同
染料墨水一般是水溶性墨水；顏料墨水是不溶於水的，所以需要超細分散後才能適用。
3、防水效能不同
染料墨水的染料著色劑存在有大量的親水粒子，易溶解。這樣一旦列印稿遇水，原先在介質上固定好的著色劑將再次溶解，並隨著水的流動向四周擴散，造成嚴重的暈染現象。
顏料墨水由於顏料不溶於水，在列印紙張遇到水分時耐水性較強。
4、化學效能不同
染料墨水的著色劑直接暴露在空氣中，在光線和臭氧等的作用下，染料著色劑的化學鏈可能斷裂，造成著色劑變色等現象，使列印稿褪色，從而影響其儲存效能。
顏料墨水的化學穩定性和光學穩定性好，耐水性和耐光性好，安全性高，列印顏色銳度和密度高。較大的顏料聚集體受到紫外線和臭氧作用時，僅僅表面層被破壞，內層的著色劑仍保持其顏色特性，因此有較高的耐光耐氣候牢度。
5、使用時噴頭堵塞情況不同
顏料墨水顆粒大，很容易造成堵頭，列印的圖象色澤不好，不鮮豔。
染料墨水不易發生堵塞噴頭的現象，即便是堵塞，疏通噴頭也較為簡單。
6、使用效果不同
顏料墨水噴繪後易於被材料吸收，並且列印在平整光滑的紙張上，對光的放射表現很好，因此色彩還原的能力比較強，打印出來的圖象色彩豔麗。
但由於染料墨水不像顏料墨水一樣表面有一層聚合物的保護，因此在在惡劣的條件下，分子容易分解，造成褪色。
7、顯色原理不同
染料墨水滲入到介質分子隙間沉澱後再形成色彩；顏料墨水是透過著色劑(顏料)以物理形式（使用高分子聚合物為粘合劑）附著在介質表面（如影印紙或列印材料等）後顯色的。