1、種類不同

巴旦木是桃屬中扁桃亞屬的植物;

而杏仁屬於薔薇科植物。

2、 形狀不同

杏仁果為扁平卵形，一端圓，另一端尖;

巴旦木的果實呈扁而長，好似橢圓的形狀。

3、產地不同

巴旦木是新疆維吾爾人民最珍視的乾果，主要產在天山以南喀什綠洲的疏附、英吉沙、莎車、葉城等縣。

杏仁主要分佈於河北、遼寧、東北、華北和甘肅等地。

4、個頭大小不同

杏仁果實比巴旦木果實小很多。

5、果殼堅硬程度不同

杏仁果果殼較硬，不易剝開;

巴旦木的果殼很薄，用指甲蓋就能摳開。

6、果實的表皮顏色不同

杏仁果覆有一層褐色的薄皮;而巴旦木的果皮呈土黃色。

7、果實氣味不同

巴旦木的果實有特殊的甜香風味。杏仁的氣味芳香微苦。

8、功效不同

巴旦木：

巴旦木營養價值比同重量的牛肉高6倍，含有少量胡蘿蔔素，維生素B1，B2和消化酶、杏仁素酶、杏仁成、鈣、鎂、鈉、鉀，同時含有鐵鈷等18種微量元素。

巴旦木可以安神，開竅，健腦，明目益腎，潤肺，潤腸，生精，健身，健胃等。主治心悸喘咳，腎氣不足，腰膝痠軟，陽痿尿頻等病症。除與漢族用藥的相同之處外，維藥甜巴旦木更具其獨特的功效。

杏仁：

杏仁含有豐富的但不飽和脂肪酸，有益於心臟健康;含有維生素E等抗氧化物質，能預防疾病和早衰。

雖然杏仁有許多的藥用，食用價值，但不可以大量使用。杏仁含有毒物質氫氰酸，過量服用可致中毒。所以，使用前必須現在水中浸泡多次，餅加熱煮沸，減少以至消除其中的有毒物質。