很遺憾的告訴你，有影響，但是不同方面影響不同。

首先，這些檔案系統在日常使用中是沒有顯著區別的，但是一到一些稀奇古怪的條件下，差距就很大了。

大多數情況下的隨身碟格式都是FAT32格式，因為它的相容性相對好一些，幾乎可以完美應對所有作業系統，並且快速的進行讀寫工作。但是它的缺點是是不能設定許可權，安全等級較低。並且最關鍵的一點就是它最高只能支援4G以下的單個檔案傳輸。

NTFS格式的隨身碟或硬碟，可以設定許可權，這就有很多文章可以做了。在互換性和實用性來說，NTFS遠高於FAT3。並且最大的可讀寫檔案達到了256T。即是指只要是隨身碟或者硬碟能放得下的檔案幾乎都可以進行讀寫。

exFAT，是FAT32的升級版也可以說是FAT64，主要目的就是為了解決FAT32不能儲存單個檔案高於4G的問題。最大支援256GB拓展。並且系統相容能力十分出眾。

這是三個檔案系統的區別，文尾扣題，檔案系統對於速度的影響微乎其微，更多的區別則體現在相容性、安全性、單檔案大小、是否進行4k對齊及對齊方式上。而對於速度的影響更多這是源於介面版本、記憶體晶片顆粒、晶片主控。

一、磁碟格式不同 1、NTFS：是Windows NT核心的系列作業系統支援的、一個特別為網路和磁碟配額、檔案加密等管理安全特性設計的磁碟格式。 2、FAT32：是檔案分配表是採用32位二進位制數記錄管理的磁碟檔案管理方式，因FAT類檔案系統的核心是檔案分配表。 二、特點不同 1、NTFS：提供長檔名、資料保護和恢復，能透過目錄和檔案許可實現安全性，並支援跨越分割槽。 2、FAT32：FAT32檔案系統中，除了根目錄外，全部子目錄均在被使用過程中，根據具體的需要而建立。若在根目錄之下建立了一個新的子目錄，則稱該子目錄是根目錄的子目錄，並且稱根目錄為該子目錄的父目錄。 三、優缺點不同 1、NTFS：支援元資料，並且使用了高階資料結構，以便於改善效能、可靠性和磁碟空間利用率，並提供了若干附加擴充套件功能。 2、FAT32：是穩定性和相容性好，能充分相容Win 9X及以前版本，且維護方便。缺點是安全性差，且最大隻能支援32GB分割槽，單個檔案也只能支援最大4GB。 來源：-FAT32 來源：-ntfs