熱帶魚中，除卵胎生魚喜歡弱鹼性軟水外，大多數都喜歡在微酸性軟水中生活，但也有少數個別魚種偏愛鹼性軟水。所謂水質，主要是指水的酸鹼度和水的硬度。酸鹼度，是指水中pH值的高低，它是由水中游離氫的數量決定的。硬度，則表示水中鈣、鎂等離子含量的多少。水pH值大於7為鹼性，小於7為酸性，等於7為中性。測定水的酸鹼度，可用pH試紙放入水中測試，水質偏酸，可加入小蘇打，使水質向鹼性轉變；偏鹼，可加入磷酸二氫鈉，使其向酸性轉變。熱帶魚對水的硬度雖各有所好，但要求不苛刻，不如對溫度那麼敏感。飼養熱帶魚時，硬度大於8為硬水，小於8為軟水。降低水的硬度可用兌水法，即向飼水中兌入適量軟化水來降低水的硬度。兌入的軟水可以是涼白開水、蒸餾水和去離子水。根據對魚生活習性的調查分析，發現絕大多數熱帶魚需要生活在弱酸性的水中。只有滿足這個要求，熱帶魚才能健康成長，色澤鮮亮活潑可愛。因此，水族箱準備好之後，不要急於立即養魚，應當觀察幾天，當發現水生植物開始生根發芽後，再用蒸餾水、煮過的草炭浸出液和沒有魚病的別的水族箱中的“老水”調到弱酸性後再養魚。要做到準確測試水的酸鹼度，最好採用試紙測試。通常自來水用來養殖熱帶魚是比較好的。河水和井水也可以用來養殖熱帶魚，但要經過煮沸處理，以消滅水中可能存在的致病微生物，保護魚的安全。