MBR 工藝廢水處理具有以下主要特點：
優點：
1 出水水質優質穩定
由於膜的高效分離作用，分離效果遠好於傳統沉澱池，處理出水極其清澈，懸浮物和濁度接近於零，細菌和病毒被大幅去除，出水水質優於建設部頒發的生活雜用水水質標準( CJ25.1-89 )，可以直接作為非飲用市政雜用水進行回用。 同時，膜分離也使微生物被完全被截流在生物反應器內，使得系統內能夠維持較高的微生物濃度，不但提高了反應裝置對汙染物的整體去除效率，保證了良好的出水水質，同時反應器對進水負荷(水質及水量)的各種變化具有很好的適應性，耐衝擊負荷，能夠穩定獲得優質的出水水質。
2 剩餘汙泥產量少
該工藝可以在高容積負荷、低汙泥負荷下執行，剩餘汙泥產量低(理論上可以實現零汙泥排放)，降低了汙泥處理費用。
3 佔地面積小，不受設定場合限制
生物反應器內能維持高濃度的微生物量，處理裝置容積負荷高，佔地面積大大節省;該工藝流程簡單、結構緊湊、佔地面積省，不受設定場所限制，適合於任何場合，可做成地面式、半地下式和地下式。
4 可去除氨氮及難降解有機物
由於微生物被完全截流在生物反應器內，從而有利於增殖緩慢的微生物如硝化細菌的截留生長，系統硝化效率得以提高。同時，可增長一些難降解的有機物在系統中的水力停留時間，有利於難降解有機物降解效率的提高。
5 操作管理方便，易於實現自動控制
該工藝實現了水力停留時間( HRT )與汙泥停留時間( SRT )的完全分離，執行控制更加靈活穩定，是汙水處理中容易實現裝備化的新技術，可實現微機自動控制，從而使操作管理更為方便。
6 易於從傳統工藝進行改造
該工藝可以作為傳統汙水處理工藝的深度處理單元，在城市二級汙水處理廠出水深度處理(從而實現城市汙水的大量回用)等領域有著廣闊的應用前景。
缺點：
膜-生物反應器也存在一些不足。主要表現在以下幾個方面：
1膜造價高，使膜 - 生物反應器的基建投資高於傳統汙水處理工藝;
2 膜汙染容易出現，給操作管理帶來不便;
3 能耗高：首先 MBR 泥水分離過程必須保持一定的膜驅動壓力，其次是 MBR 池中 MLSS 濃度非常高，要保持足夠的傳氧速率，必須加大曝氣強度，還有為了加大膜通量、減輕膜汙染，必須增大流速，沖刷膜表面，造成 MBR 的能耗要比傳統的生物處理工藝高。
由於膜通量的提高、膜壽命的延長會大幅度降低MBR的執行費用，因此，在保證出水水質的前提下，膜通量應儘可能大，這樣可減少膜的使用面積，降低基建費用與執行費用。因此控制膜汙染，保持較高的膜通量，是MBR研究的重要內容。而膜通量與膜材料、操作方式、水力條件等因素密切相關。
能耗
能耗是汙水處理工藝的一個重要的評價指標，直接關係到處理方法的可行性。目前，常規分離式MBR執行能耗為3～4 kW"h/m3，淹沒式MBR執行能耗為0.6～2 kW"h/m3，高於活性汙泥法的0.3～0.4 kW"h/m3。
較高的動力費用是MBR推廣應用中遇到的主要問題之一。許多研究結果也表明：能耗是造成MBR執行費用高的主要原因。
分離式MBR的能耗組成：泵的熱能損失、曝氣能耗、管道阻力能耗、膜元件能耗和迴流汙泥水頭損失能耗，其耗能大小依次為：膜元件>泵>曝氣>管道>迴流汙泥，膜元件能耗佔總能耗的40%～50%，其中80%用於膜過濾的能量以熱能的方式散發。其中曝氣的能耗佔總能耗的96%以上。
MBR 工藝廢水處理具有以下主要特點：
優點：
1 出水水質優質穩定
由於膜的高效分離作用，分離效果遠好於傳統沉澱池，處理出水極其清澈，懸浮物和濁度接近於零，細菌和病毒被大幅去除，出水水質優於建設部頒發的生活雜用水水質標準( CJ25.1-89 )，可以直接作為非飲用市政雜用水進行回用。 同時，膜分離也使微生物被完全被截流在生物反應器內，使得系統內能夠維持較高的微生物濃度，不但提高了反應裝置對汙染物的整體去除效率，保證了良好的出水水質，同時反應器對進水負荷(水質及水量)的各種變化具有很好的適應性，耐衝擊負荷，能夠穩定獲得優質的出水水質。
2 剩餘汙泥產量少
該工藝可以在高容積負荷、低汙泥負荷下執行，剩餘汙泥產量低(理論上可以實現零汙泥排放)，降低了汙泥處理費用。
3 佔地面積小，不受設定場合限制
生物反應器內能維持高濃度的微生物量，處理裝置容積負荷高，佔地面積大大節省;該工藝流程簡單、結構緊湊、佔地面積省，不受設定場所限制，適合於任何場合，可做成地面式、半地下式和地下式。
4 可去除氨氮及難降解有機物
由於微生物被完全截流在生物反應器內，從而有利於增殖緩慢的微生物如硝化細菌的截留生長，系統硝化效率得以提高。同時，可增長一些難降解的有機物在系統中的水力停留時間，有利於難降解有機物降解效率的提高。
5 操作管理方便，易於實現自動控制
該工藝實現了水力停留時間( HRT )與汙泥停留時間( SRT )的完全分離，執行控制更加靈活穩定，是汙水處理中容易實現裝備化的新技術，可實現微機自動控制，從而使操作管理更為方便。
6 易於從傳統工藝進行改造
該工藝可以作為傳統汙水處理工藝的深度處理單元，在城市二級汙水處理廠出水深度處理(從而實現城市汙水的大量回用)等領域有著廣闊的應用前景。
缺點：
膜-生物反應器也存在一些不足。主要表現在以下幾個方面：
1膜造價高，使膜 - 生物反應器的基建投資高於傳統汙水處理工藝;
2 膜汙染容易出現，給操作管理帶來不便;
3 能耗高：首先 MBR 泥水分離過程必須保持一定的膜驅動壓力，其次是 MBR 池中 MLSS 濃度非常高，要保持足夠的傳氧速率，必須加大曝氣強度，還有為了加大膜通量、減輕膜汙染，必須增大流速，沖刷膜表面，造成 MBR 的能耗要比傳統的生物處理工藝高。
由於膜通量的提高、膜壽命的延長會大幅度降低MBR的執行費用，因此，在保證出水水質的前提下，膜通量應儘可能大，這樣可減少膜的使用面積，降低基建費用與執行費用。因此控制膜汙染，保持較高的膜通量，是MBR研究的重要內容。而膜通量與膜材料、操作方式、水力條件等因素密切相關。
能耗
能耗是汙水處理工藝的一個重要的評價指標，直接關係到處理方法的可行性。目前，常規分離式MBR執行能耗為3～4 kW"h/m3，淹沒式MBR執行能耗為0.6～2 kW"h/m3，高於活性汙泥法的0.3～0.4 kW"h/m3。
較高的動力費用是MBR推廣應用中遇到的主要問題之一。許多研究結果也表明：能耗是造成MBR執行費用高的主要原因。
分離式MBR的能耗組成：泵的熱能損失、曝氣能耗、管道阻力能耗、膜元件能耗和迴流汙泥水頭損失能耗，其耗能大小依次為：膜元件>泵>曝氣>管道>迴流汙泥，膜元件能耗佔總能耗的40%～50%，其中80%用於膜過濾的能量以熱能的方式散發。其中曝氣的能耗佔總能耗的96%以上。