玉米的種子主要由種皮、胚乳和胚3部分組成

種皮（seed coat）：果皮與種皮緊密相連不易區分，習慣上均稱之為種皮。種皮主要有纖維素構成，表面光滑，一般無色，包圍整個種子，約佔種子總重量的6%-8%。具有保護種子不受外力機械損傷和防止病蟲害入侵的作用。

胚乳（endosperm）：玉米的胚乳位於種皮內部，最外層由單層細胞組成，這些細胞充滿含有大量蛋白質的糊粉粒，組成糊粉層。糊粉層下不的胚乳分為粉質胚乳、角質胚乳（二者是由蛋白質所佔比例不同來區分的）。胚乳佔種子總重量的80%-85%。起到貯藏養料，供給種子萌發的作用。

胚（embryo）：新生植物體的雛體，構成種子的最重要部位。胚有胚根、胚芽、胚軸、子葉（盾片）組成。胚根與胚芽的頂端具有生長點，由胚性細胞組成，種子萌發時，這些胚性細胞能很快分裂、長大，使胚根和胚芽分別伸長，突破種皮，長成新植株的根、莖、葉。同時，胚軸也一起生長，成為幼根或幼莖的一部分。子葉是植物體最早的葉，它是種子植物胚的組成部分之一，在大多數植物中為貯藏養料或幼苗時期進行同化作用的器官。（在無胚乳的種子內，子葉特別肥厚，貯藏著大量的營養物質。在有胚乳的種子內，子葉不發達，但它可從胚乳中吸收養料，供胚發育需要，所以子葉在種子萌發成幼苗的初期，其作用是十分重要的。）禾本科植物種子內的子葉，又稱為“內子葉”或“盾片”，其功能較為特殊，具有吸收和消化作用。玉米的胚佔種子總重量的10%-15%