林蛙的越冬是養殖林蛙成敗的關鍵環節之一。越冬期管理不好，林蛙成活率低，情況嚴重的會全部死亡。越冬時，幼蛙、成蛙、親蛙應分開越冬。若同池越冬，可用攔網將幼蛙、成蛙、親蛙分開。

林蛙的越冬主要有山澗溪流越冬、室外池塘越冬、大水庫網箱越冬、地窖越冬、塑膠大棚越冬、室內水池越冬等幾種方法。

林蛙越冬可分為4個時期：入水期、散居冬眠期、群居冬眠期和冬眠活動期。

入水期是從林蛙下山後的9月下旬開始，為期半個月左右，多數林蛙都單獨分散於淺水區域。當氣溫降至10℃以下時，林蛙從陸地進入水中，當氣溫高於10℃時林蛙又重新上岸活動，有的林蛙還會繼續取食，呈兩棲交替生活方式。林蛙時而進入水中，時而爬上陸地，也是在逐步地適應水中的生活，適應完全靠面板進行呼吸的過程。

散居冬眠期從10月中旬到11月中旬，為期1個月左右。林蛙在較淺的流水或池水中，常單獨地分散潛伏於溪流裡的石塊下、樹根水草間，夜間在淺水活動，尋找新的、適宜的冬眠場所，但不上岸活動。

當水面封凍以後，林蛙開始聚集到深水區，開始群居冬眠。群居冬眠期從11月中旬到第二年的3月末至4月初結束。林蛙入水冬眠後停止用肺呼吸，完全靠面板呼吸。冬眠時林蛙呼吸微弱，體溫靠吸收環境熱量維持。林蛙進入深度的群居冬眠時，一般成群擠在一起冬眠。一齡幼蛙沒有明顯的群居冬眠現象。

冬眠活動期是從3月末到4月上旬，10天左右。這時林蛙的冬眠群體開始分開或部分分開，在水中做短距離遊動，但並不上岸生活。

當氣溫和水溫升高時，林蛙開始出河上岸在水邊活動，氣溫下降時仍回到水中，當氣溫上升到10℃以上時，林蛙沿溪流兩側溼潤植物帶上山。多數林蛙集中在1～2個夜晚上山。幼蛙比成蛙出河晚10～20天，剛出河的幼蛙並不立即上山，有的在水邊活動，有的在陸地潛伏，氣溫穩定後再集中上山。