酸性土壤中有高濃度的H+ , A13+ , Mn 2+和Fe2+等 酸性土壤普遍缺氮、磷和鉀；很多土壤缺鈣和鎂；有些土壤缺鉬。這些養分的缺乏主要是由酸性土壤組成的特性及氣候特點所決定的。酸性土壤中鐵、鋁活性高，與磷形成難溶性的鐵磷和鋁磷，甚至有效性更低的閉蓄態磷，使土壤磷和施入土壤中的肥料磷絕大部分轉化為固定態磷，致使絕大多數的酸性土壤都嚴重缺磷。由於酸性土壤風化比較徹底，黏土礦物又以1：1型的高嶺石為主，因而陽離子交換量低，對陽離子的吸附能力弱。在溼潤條件下，使土壤發生強烈淋溶作用，造成K＋,Ca2＋,Mg 2+等礦質養分離子的大量淋失，其中一價離子K＋尤為嚴重。這是中國南方酸性土壤地區嚴重缺鉀的主要原因。由於強烈的淋溶作用，酸性土壤的鈣鎂含量普遍較低，其結果，一方面可使作物因缺乏鈣、鎂而限制其生長；另一方面又會因鹽基離子的淋失而增加土壤的酸度，提高鋁的溶解度，從而造成鋁毒等次生不良影響。酸性土壤上很多作物常出現缺鎂現象，森林死亡是世界上最引人注目的一大生態危機。據研究，植物缺鎂是造成森林植物死亡的重要原因之一。 酸性土壤上的許多作物易出現缺鉬。因為在低pH值土壤條件下，對植物有效的水溶性鉬易於轉化為溶解度很低的氧化態鉬，使得鉬的有效性大大降低。因而，酸性土壤上施鉬常能獲得較好的增產效果。