這是古代的正統思想導致的，《三國演義》的擁劉反曹思想確實是民間比較認可的。所以確實是以蜀漢為正統。

曹操生前沒稱帝，雖然被追封為帝，但是沒有曹操也正常。因為以蜀漢為正統，所以吳國和魏國的皇帝都沒有入祭也是正常的。既然曹魏的正統性都不被認可，那麼接受曹魏禪讓的西晉自然也不被認可。東晉第一位皇帝晉元帝卻在帝王廟中，是因為東晉儲存了漢族血統與文化，是有功勞的，這是特定的時代導致的。

何止是曹魏，東吳的皇帝沒入選，就連秦始皇，晉武帝，隋文帝都沒入選。本來朱元璋一開始入祀十六位帝王，是有隋文帝的，後來朱元璋把隋文帝給移出來了。這和隋朝短命是有很大關係的。秦朝也是如此，秦始皇被認為是暴君，不給入祀。西晉二世而亂，也涉及到上述所說的正統性的問題。說白了就是祭祀他們不吉利。雖然他們本身有很多功績，但是奈何王朝短命。

到了清朝，入祀的帝王不斷增加，康熙曾經留下諭旨：除了因無道被殺和亡國之君外，所有曾經在位的歷代皇帝，廟中均應為其立牌位。

在帝王廟中，還有79位名臣。其中三國時代入選的是諸葛亮和趙雲。這已經明顯得不能再明顯了，就是以蜀漢為正統。而劉禪亡國，沒有入選。所以東漢之後，只有劉備入選，之後一直到東晉才有晉元帝。

其實一直到北宋，都是以曹魏為正統的。西晉一統，西晉是接受曹魏的禪讓，曹魏自然是正統。司馬光呈給皇上的《資治通鑑》明確地使用曹魏的年號。司馬光的理由是誰佔據中原誰就是正統，不佔據中原的就是偏安小朝廷。南宋朱熹編修《通鑑綱目》, 號稱“辨名分，正綱常”，以蜀漢紀年代替曹魏紀年。當時金國佔據曹魏的地形，也就是佔據中原，南宋偏安蘇杭，只好自比蜀漢。東吳是既沒有佔中原，又沒有禪讓之名，更不是漢室宗親，怎麼輪都輪不到他。