黑暗組織
001 雲霄飛車殺人事件
005 新幹線大爆破事件
054 電玩公司殺人事件
128 黑暗組織10億元搶劫事件
129 來自黑暗組織的女子 大學教授殺人事件
176 與黑暗組織的再會(灰原編)
177 與黑暗組織的再會(柯南編)
178 與黑暗組織的再會(解決編)
230 迷一樣的乘客(前編)
231 迷一樣的乘客(後編)
258 來自芝加哥的男人(前編)
259 來自芝加哥的男人(後編)
269 犯罪的紀念品(前編)
270 犯罪的紀念品(後編)
271 急忙掩飾的忽略(前編)
272 急忙掩飾的忽略(後編)
277 英語教師VS西部名偵探(前編)
278 英語教師VS西部名偵探(後編)
279 迷宮的陰暗（前篇）
284 中華街雨中的似曾相識(前編)
285 中華街雨中的似曾相識(後編)
286 工藤新一NY事件(事件編)
287 工藤新一NY事件(推理編)
288 工藤新一NY事件(解決編)
289 迷途森林的光彥(前編)
290 迷途森林的光彥(後編)
307 沒有留下聲音的證據(前編)
308 沒有留下聲音的證據(後編)
309 與黑暗組織接觸(交涉編)
310 與黑暗組織接觸(追擊編)
311 與黑暗組織接觸(決死編)
335 東都顯影所的秘密（前篇）
336 東都顯影所的秘密（後篇）
338 4臺保時捷（前篇）
339 4臺保時捷（後篇）
340 廁所隱藏的秘密（前篇）
341 廁所隱藏的秘密（後篇）
343 小蘭的推理（前編）
344 小蘭的推理（前編）
345 與黑衣組織直面對決滿月之夜的雙重迷案
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和諧音（前奏曲）
386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和諧音（間奏曲)
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和諧音（後奏曲）
394 奇異屋宇的大冒險（封印篇）
425 Black impact ! 被組織的魔掌觸碰的瞬間
491 紅與黑的碰撞 開始
492 紅與黑的碰撞 血緣
493 紅與黑的碰撞 絕叫
494 紅與黑的碰撞 冥土
495 紅與黑的碰撞 昏睡
496 紅與黑的碰撞 侵入
497 紅與黑的碰撞 覺醒
498 紅與黑的碰撞 擾亂
499 紅與黑的碰撞 偽裝
500 紅與黑的碰撞 遺言
501 紅與黑的碰撞 嫌疑
怪盜基德
在《名偵探柯南》動畫中的登場：
076《柯南VS怪盜基德》
132《魔術愛好者殺人事件（事件篇）》
133《魔術愛好者殺人事件（疑惑篇）》
134《魔術愛好者殺人事件（解決篇）》
219《名偵探大集合 工藤新一VS怪盜基德》
356《怪盜基德之奇異的空中步行》
394《奇異屋宇的大冒險（封印篇）》
395《奇異屋宇的大冒險（機關篇）》
396《奇異屋宇的大冒險（解決篇）》
469《基德與四幅名畫（前篇）》
470《基德與四幅名畫（後篇）》
473《工藤新一少年時的冒險》
515 怪盜基德的瞬間移動魔術
黑暗組織
001 雲霄飛車殺人事件
005 新幹線大爆破事件
054 電玩公司殺人事件
128 黑暗組織10億元搶劫事件
129 來自黑暗組織的女子 大學教授殺人事件
176 與黑暗組織的再會(灰原編)
177 與黑暗組織的再會(柯南編)
178 與黑暗組織的再會(解決編)
230 迷一樣的乘客(前編)
231 迷一樣的乘客(後編)
258 來自芝加哥的男人(前編)
259 來自芝加哥的男人(後編)
269 犯罪的紀念品(前編)
270 犯罪的紀念品(後編)
271 急忙掩飾的忽略(前編)
272 急忙掩飾的忽略(後編)
277 英語教師VS西部名偵探(前編)
278 英語教師VS西部名偵探(後編)
279 迷宮的陰暗（前篇）
284 中華街雨中的似曾相識(前編)
285 中華街雨中的似曾相識(後編)
286 工藤新一NY事件(事件編)
287 工藤新一NY事件(推理編)
288 工藤新一NY事件(解決編)
289 迷途森林的光彥(前編)
290 迷途森林的光彥(後編)
307 沒有留下聲音的證據(前編)
308 沒有留下聲音的證據(後編)
309 與黑暗組織接觸(交涉編)
310 與黑暗組織接觸(追擊編)
311 與黑暗組織接觸(決死編)
335 東都顯影所的秘密（前篇）
336 東都顯影所的秘密（後篇）
338 4臺保時捷（前篇）
339 4臺保時捷（後篇）
340 廁所隱藏的秘密（前篇）
341 廁所隱藏的秘密（後篇）
343 小蘭的推理（前編）
344 小蘭的推理（前編）
345 與黑衣組織直面對決滿月之夜的雙重迷案
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和諧音（前奏曲）
386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和諧音（間奏曲)
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和諧音（後奏曲）
394 奇異屋宇的大冒險（封印篇）
425 Black impact ! 被組織的魔掌觸碰的瞬間
491 紅與黑的碰撞 開始
492 紅與黑的碰撞 血緣
493 紅與黑的碰撞 絕叫
494 紅與黑的碰撞 冥土
495 紅與黑的碰撞 昏睡
496 紅與黑的碰撞 侵入
497 紅與黑的碰撞 覺醒
498 紅與黑的碰撞 擾亂
499 紅與黑的碰撞 偽裝
500 紅與黑的碰撞 遺言
501 紅與黑的碰撞 嫌疑
怪盜基德
在《名偵探柯南》動畫中的登場：
076《柯南VS怪盜基德》
132《魔術愛好者殺人事件（事件篇）》
133《魔術愛好者殺人事件（疑惑篇）》
134《魔術愛好者殺人事件（解決篇）》
219《名偵探大集合 工藤新一VS怪盜基德》
356《怪盜基德之奇異的空中步行》
394《奇異屋宇的大冒險（封印篇）》
395《奇異屋宇的大冒險（機關篇）》
396《奇異屋宇的大冒險（解決篇）》
469《基德與四幅名畫（前篇）》
470《基德與四幅名畫（後篇）》
473《工藤新一少年時的冒險》
515 怪盜基德的瞬間移動魔術