免費疫苗和自費疫苗是不衝突的，但是要看打的都是什麼疫苗，功效類似的疫苗，都是預防某類疾病的，假設自費的是滅活性質的疫苗而免費的是減活性質的，打了自費再打免費的就沒有必要了。

無論是先打的自費還是免費的，都要看後期打疫苗時間的安排，小月領的寶寶每個月都有需要打的疫苗，但是大部分疫苗都是要間隔一個月以上再打下一個，所以要看時間，得能排的開。

通常而言，免費疫苗都是必打的，是一類疫苗，自費的可以自行選擇的二類疫苗。

供參考。

不管是免費還是自費，給孩子打疫苗都有個時效問題，因為小孩處於不同的發育階段，對抗原刺激的反應性也不同，由於小孩需要接種的疫苗種類多，而且有的疫苗製劑需要多次接種才能產生免疫性。由於接種後不論是產生免疫性的時間，還是疾病的流行季節都不同，在加上各種疫苗之間有無干擾等因素，都會對免疫產生應響。所以、在給小孩打疫苗時，不論是自費還是免費，都一定要按照衛生部門的計劃免疫程式，給孩子按時按常規免疫程式接種，只有這樣才能達到免疫的作用，千萬不要拖過免疫時間，否則有些疫苗會不起作用。另外由於小孩的體質不同，有些疫苗製劑在小孩生病時禁用，所以不論是免費還是自費給小孩接種時，都要一定給小孩作體檢檢查。只要在接種時期內，給小孩接種，就會起到免疫的作用！