目前人類的科學研究和生產實踐已經證實進化論的正確性，進化論的理論大方向肯定是正確的，但是和其它任何理論一樣，進化論自然也存在不足，不可能解釋一切生物學問題。
地球生物組成方式和基因的相似性證實了地球生物必然有多種聯絡，除了進化論再也找不出第二種能夠更完美解釋生物來源的理論體系，但是地球生命已經出現近38億年了，從達爾文時代科學家們才想起來根據化石和現存生物的相似性和差異性去弄明白生物的來源，由於地球生命歷史過於久遠，絕大多數的生物都無法留下化石，就算留下了以人類對地球的探索範圍也難以發現，基因證據目前也只能追溯到16萬年前，很多生物之間的聯絡更多是透過結構的相似性來判斷的，更關鍵的基因證據卻無能為力，因此會有一些推測可能並不準確，在未來可能會被推翻。但是進化論的主要思想基於環境選擇的進化史觀，其正確性已經在現代科學中被證實。
比較明顯的例子是超級細菌、超級真菌等，人類現代已經找到了很多針對有害細菌真菌的藥物，藥物的作用也不能將細菌全部殺滅，而是將其在人體中的水平降到不足以危害人體的程度，餘下的部分會被人體免疫系統清除，但是每一種藥物用一段時間後，前期會有大量菌株死亡，後期卻會有抗藥菌株的大量產生，這裡藥物就是作為環境因素對原本的菌群做出了選擇，其中天然的具有抗藥細菌的菌株留了下來，由於細菌的繁殖是分裂增殖，後代菌株幾乎可以具有前代菌株所有的有利於生存的基因，多代選擇下具有多種抗藥基因的超級細菌就產生了。
除了人類基因組計劃，各國科學家也開展過一些樣本較大人群的基因組計劃，國外曾完成過以分針對一二十萬不同代的人群的基因檢測統計家胡，發現現代人類在酒精、菸草有害物質的抗性方面已經發生了變化，主要是相關基因的種群頻率的變化。基因是人類最重要的生命物質，反映在基因層面的證據是最重要的證據，但是這些證據依然不能解釋怎麼就突變產生了相應的基因，只知道是環境因素影響發生的。
現代生物進化理論還不能完全解釋長頸鹿脖子為什麼那樣長的問題，根據地質遺留資訊，當時的非洲草原的植被並不像以往推測的樹木越長越高，因此也就不存在長頸鹿為了吃樹葉脖子逐漸拉長，它們脖子那麼長毫無疑問還是種群基因庫中基因頻率的改變。根據基因檢測，基因突變是隨時都可能發生的，而其中絕大多數對生物的生存無害也沒有好處，現代進化論也不能很好解釋中性突變的問題。還有就是生殖隔離的產生，由於生物的遺傳性是遺傳物質為基礎的，就算地理隔離是導致新物種產生的原因，但是一個種群中的生物，不可能同時出現完全一致的突變，尤其是大型兩性繁殖的生物，個體不足無法維持種群，個體數量太多又不可能產生完全一致的突變，尤其是染色體數量的變化，生物種群該怎麼遺傳繁衍下去？
只能說現代人類的科學水平還不足，進化論主要思想的正確性已經毋庸置疑，但是依然有大量的進化謎題無法解開，主要是由於地球生命的歷史很久遠，生物多樣性又很複雜，尚無法總結出一套能解釋所有生物學問題的理論體系。不過現代生物進化理論已經被應用於生產實踐，基因技術等都是具體形式，使生產實踐的有利結論再次驗證了進化論的正確性，只是還有大量的細節需要補充進去。
目前人類的科學研究和生產實踐已經證實進化論的正確性，進化論的理論大方向肯定是正確的，但是和其它任何理論一樣，進化論自然也存在不足，不可能解釋一切生物學問題。
地球生物組成方式和基因的相似性證實了地球生物必然有多種聯絡，除了進化論再也找不出第二種能夠更完美解釋生物來源的理論體系，但是地球生命已經出現近38億年了，從達爾文時代科學家們才想起來根據化石和現存生物的相似性和差異性去弄明白生物的來源，由於地球生命歷史過於久遠，絕大多數的生物都無法留下化石，就算留下了以人類對地球的探索範圍也難以發現，基因證據目前也只能追溯到16萬年前，很多生物之間的聯絡更多是透過結構的相似性來判斷的，更關鍵的基因證據卻無能為力，因此會有一些推測可能並不準確，在未來可能會被推翻。但是進化論的主要思想基於環境選擇的進化史觀，其正確性已經在現代科學中被證實。
比較明顯的例子是超級細菌、超級真菌等，人類現代已經找到了很多針對有害細菌真菌的藥物，藥物的作用也不能將細菌全部殺滅，而是將其在人體中的水平降到不足以危害人體的程度，餘下的部分會被人體免疫系統清除，但是每一種藥物用一段時間後，前期會有大量菌株死亡，後期卻會有抗藥菌株的大量產生，這裡藥物就是作為環境因素對原本的菌群做出了選擇，其中天然的具有抗藥細菌的菌株留了下來，由於細菌的繁殖是分裂增殖，後代菌株幾乎可以具有前代菌株所有的有利於生存的基因，多代選擇下具有多種抗藥基因的超級細菌就產生了。
除了人類基因組計劃，各國科學家也開展過一些樣本較大人群的基因組計劃，國外曾完成過以分針對一二十萬不同代的人群的基因檢測統計家胡，發現現代人類在酒精、菸草有害物質的抗性方面已經發生了變化，主要是相關基因的種群頻率的變化。基因是人類最重要的生命物質，反映在基因層面的證據是最重要的證據，但是這些證據依然不能解釋怎麼就突變產生了相應的基因，只知道是環境因素影響發生的。
現代生物進化理論還不能完全解釋長頸鹿脖子為什麼那樣長的問題，根據地質遺留資訊，當時的非洲草原的植被並不像以往推測的樹木越長越高，因此也就不存在長頸鹿為了吃樹葉脖子逐漸拉長，它們脖子那麼長毫無疑問還是種群基因庫中基因頻率的改變。根據基因檢測，基因突變是隨時都可能發生的，而其中絕大多數對生物的生存無害也沒有好處，現代進化論也不能很好解釋中性突變的問題。還有就是生殖隔離的產生，由於生物的遺傳性是遺傳物質為基礎的，就算地理隔離是導致新物種產生的原因，但是一個種群中的生物，不可能同時出現完全一致的突變，尤其是大型兩性繁殖的生物，個體不足無法維持種群，個體數量太多又不可能產生完全一致的突變，尤其是染色體數量的變化，生物種群該怎麼遺傳繁衍下去？
只能說現代人類的科學水平還不足，進化論主要思想的正確性已經毋庸置疑，但是依然有大量的進化謎題無法解開，主要是由於地球生命的歷史很久遠，生物多樣性又很複雜，尚無法總結出一套能解釋所有生物學問題的理論體系。不過現代生物進化理論已經被應用於生產實踐，基因技術等都是具體形式，使生產實踐的有利結論再次驗證了進化論的正確性，只是還有大量的細節需要補充進去。