有機化合物與無機化合物主要有組成、溶解性、化學反應快慢和作用四個方面的區別：

1、組成不同有機物是含碳化合物或碳氫化合物及其常見衍生物的總稱。有機化合物除含碳元素外，還可能含有氫、氧、氮、氯、磷和硫等元素。無機物主要是由水和無機鹽組成的，其中水又可以分類為：結合水和自由水，結合水是細胞結構的重要組成成分。無機鹽可分為：離子和化合物，離子是維護細胞正常的生命活動，化合物是細胞內化合物的重要組成物分。

2、溶解性不同有機化合物多數不溶於水，易溶於有機溶劑，如油脂溶於汽油，媒油溶於萃。無機化合物有些溶於水，而不溶於有機溶劑，如食鹽、明璣溶於 水。

3、化學反應快慢不同有機化合物的化學反應一般比較複雜，副反應多，較慢，如生成乙酸乙酯的酯化反應在常溫下要16年才能達到平衡。無機化合物的化學反應一般簡單，副反應少，反應快，如氯化鈉和硝酸銀反應瞬間完成。

4、作用不同有機物是生命產生的物質基礎，所有的生命體都含有機化合物。生物體內的新陳代謝和生物的遺傳現象，都涉及到有機化合物的轉變。許多與人類生活有密切相關的物質，如石油、天然氣、棉花、染料、化纖、塑膠、合成藥物等，均與有機化合物有著密切聯絡。無機化合物中的結合水是細胞結構的重要組成成分，自由水用於運輸營養物質或代謝廢物，參與細胞內的光合作用、呼吸作用等生化反應。無機化合物中的無機鹽對於維持細胞和生物體的生命活動有重要意義，生物體內的無機鹽離子必須保持一定量，以維持細胞的酸鹼平衡。