黃河斷流的原因有很多，概括起來主要有以下幾點：

1.全球變暖。隨著近年來全球變暖情況的加劇，一方面使得河道的蒸發量大增，另一方面春夏季上游冰川的溶化大量吸收熱量，造成內陸區域性氣溫低於往常，這就減小了內陸和海洋之間的溫差，進而造成季風減弱，缺少了季風從海面帶進內陸的水汽。雖然全球變暖使得冰川融化加大了上游水源的流量，但卻抵消不了蒸發量的提高和季風減弱的影響效應。最終造成中下游的水量逐年減少。

2.植被破壞。黃土高原地區植被破壞嚴重，缺少了植被涵養的土地逐步沙漠化，蒸發量變得更高，土地乾燥地下水需要不停的吸收流經河道才能得以補充。

3.灌溉方式落後。黃河中上游流經的多為經濟較不發達的老少邊窮地區，缺少節水灌溉的技術和資金，多為大水漫灌，黃河水浪費嚴重。

4.上游屬乾旱半乾旱區降水率極少，中游為主要補給區但水土流失嚴重、季節變化大，下游流域面積小，補給少；

5.流域內人口增長快，人口增長速度遠遠超過了糧食增長率；

6.近幾十年來，隨著社會發展，黃河沿岸工業和城市用水量不斷增加，引黃灌溉面積不斷擴大；

7.水庫調節能力較低，水資源管理不統一；

8.水費低廉，低水價喚不起人們的節水意識，工農業用水浪費極大；

9.環境汙染急劇降低黃河水的利用率。