商業秘密管理過程中涉及的範疇，幾乎涵蓋全企業。群龍無首和多頭馬車都可能引發管理危機。合適的商業秘密管理組織能確保商業秘密管理制度被有成效且有效率的推行。
企業中任何任務的執行都不該只是將任務完成，而是要做到位，做到好，當交付任務時應依其任務特性挑選適當的執行人員，且應授予該人員足夠的資源與授權，明確其責任已承諾，以期最終交出預期成果。因此，合宜的安排角色與責任，無疑是此複雜任務的成功要素之一。
商業秘密管理組織應負責監督及協調商業秘密管理制度的執行組織主要職責包括但不限於下列事項:
1.持續識別企業所擁有的商業秘密，並以風險概念出發，評估與規範商業秘密的使用範圍與方式;
2.依據企業特有環境設計、調整、宣導及監督各部門實施與商業秘密相關的合理保護措施，確保商業秘密管理制度的施行達到預期;
3.進行跨部門的溝通與協調，以處理各部門對商業秘密管理制度實行的反饋與障礙;
4.取得高層主管的支援、充分的授權與足夠的資源。
企業應視其規模、組織結構及需求建立適當的商業秘密管理組織。企業是否有專職的稽核部門，是否擁有專門的應變任務編組等，都會讓商業秘密管理組織的架構有些許不同，但不論組織架構如何變化，該管理組織擁有的角色與責任並不會隨之改變。
此外，影響商業秘密管理組織的因素還可能包含企業的規模大小，、規模的不同，可能會影響管理組織的成員數量，或是影響成員們是否為專職的狀態。而企業的文化可能影響授權的層績等。企業在設計商業秘密管理組織時需將相關的影響因素皆納入考量。
在此。我們依據企業的規模，提出企業可採用的三種管理組織形式，以供參考。
在該架構中，2000人以上的企業可參考A形式;
2000人以下及1000人以上的企業，可參考B形式;
1000人以下的企業可參考C形式。
這些門檻數字並非絕對，企業仍需依據其特性作出最終的決策，接下來我們將對每種形式的組織架構進行說明。
A:對大型企業而言，健全完整分配各種商業秘密管理角色並不是難事。事實上每種形式都因架構而變化。以商業秘密管理總召集人(以下簡稱總召集人)為首，帶領商業秘密管理委員會(以下簡稱委員會)，共同討論並決策與商業秘密管理相關的事宜。而商業秘密管理執行秘書，(以下簡稱執行秘書)，咋負責管理委員會的相關事物時，委員會順利運作。此外，執行秘書下亦有一群幕僚人員，稱為商業秘密管理執行小組，(以下簡稱執行小組)負責商業秘密管理制度的日常維護。
商業秘密設管理涉及全企業，若要讓商業秘密管理制度運作順利，企業各部門的參與是非常關鍵的。建議各部門至少推派一名種子人員，以協助執行秘書適當的執行和傳達與商業秘密管理相關事宜。
此外，商業秘密管理制度是否被完全落實，是否需要進行調整等議題，企業應使用完善的內部稽核程式來回答。為了保持稽核的獨立性，內部稽核負責人及成員，應直接對總召集人彙報，最後當商業秘密受侵害時，應有經訓練、熟知緊急應變計劃的商業秘密侵害事件緊急應變組，(以下簡稱應變組)接手處理。應變組內又可依其功能細分不同的角色。
建議，可設立事件管理、調查評估、溝通協調及公關媒體等角色，以協助企業彙整與管理、調查、跨部門溝通及時對外說明商業秘密侵害事件的來由與處置對策。
B:完整的商業秘密管理制度應遵循PDCA原則，確認制度是否被落實是必經過程之一，因此建議將稽核的角色配置於執行小組中。在既有的組織架構下，由執行秘書提出建議，經委員會核准，尋找並培養具備稽核專業知識且擁有技術及產業知識的人員擔任稽核的角色，其他的角色則與A形式的管理組織相同。
C:C適用於小型企業，企業組織架構較單純和彈性較大者，C形式的管理組織其稽核功能配置在執行小組中，企業無專職的稽核部門。同時企業亦未有預先設立的應變組織，僅設有應變視窗，待事件發生後，視情況調配相關權責人員進行處理。
除組織架構外，由誰來擔任各種角色，亦是企業常見的困擾，結合過往的經驗彙總，並提出角色指派的以下建議:
1.商業秘密管理總召集人:至少為副總經理級別以上職位的人員擔任，例如:董事長、總經理、人力資源部總經理、法務部總經理等;
2.商業秘密管理委員會:由企業主要事業單位、部門及工廠的最高主管組成;
3.內部稽核負責人:由公司稽核部門主管擔任;
4.商業秘密管理執行秘書:為企業的商業秘密管理代表可能的人選為總經辦、人力資源部門、法務部門等部門的人員;
5.商業秘密管理執行小組:由委員會指派溝通能力好的人員，協助執行秘書推動各項商業秘密管理制度工作，最終由總召集人任命。設定人員數量應根據企業規模決定。
6.商業秘密管理實行部門/工廠:實行部門/工廠負責人為部門和工廠的最高主管，主要負責審閱與核准相關的商業秘密管理制度檔案及表單，並指派部門和工廠的種子人員，而種子人員，由熟悉該部門和工廠業務的人員擔任尤佳。種子人員的年資至少大於一年，並具有一定的責任感與熱枕。
7.商業秘密侵害事件緊急應變組:應變處理小組召集人員由委員會推派人員擔任。亦為事件應變的單一視窗，可由法務部門、人資部門、管理部門等部門的主管擔任。而應變組的每個分組則由應變組召集人指派人員擔任組長。應變組的成員應包含發生侵害事件的權責部門及相關配合部門。
建立合適的商業秘密管理組織，絕對是商業秘密管理制度的成功要素之一，不論使用何種形式的管理組織，只要建立在管理組織具備了角色權責分配得宜、任務執行獲高層主管支援、實施者對任務有相應保證等條件，所有推動管理制度實施的行動勢必事半功倍。
商業秘密管理過程中涉及的範疇，幾乎涵蓋全企業。群龍無首和多頭馬車都可能引發管理危機。合適的商業秘密管理組織能確保商業秘密管理制度被有成效且有效率的推行。
企業中任何任務的執行都不該只是將任務完成，而是要做到位，做到好，當交付任務時應依其任務特性挑選適當的執行人員，且應授予該人員足夠的資源與授權，明確其責任已承諾，以期最終交出預期成果。因此，合宜的安排角色與責任，無疑是此複雜任務的成功要素之一。
商業秘密管理組織應負責監督及協調商業秘密管理制度的執行組織主要職責包括但不限於下列事項:
1.持續識別企業所擁有的商業秘密，並以風險概念出發，評估與規範商業秘密的使用範圍與方式;
2.依據企業特有環境設計、調整、宣導及監督各部門實施與商業秘密相關的合理保護措施，確保商業秘密管理制度的施行達到預期;
3.進行跨部門的溝通與協調，以處理各部門對商業秘密管理制度實行的反饋與障礙;
4.取得高層主管的支援、充分的授權與足夠的資源。
企業應視其規模、組織結構及需求建立適當的商業秘密管理組織。企業是否有專職的稽核部門，是否擁有專門的應變任務編組等，都會讓商業秘密管理組織的架構有些許不同，但不論組織架構如何變化，該管理組織擁有的角色與責任並不會隨之改變。
此外，影響商業秘密管理組織的因素還可能包含企業的規模大小，、規模的不同，可能會影響管理組織的成員數量，或是影響成員們是否為專職的狀態。而企業的文化可能影響授權的層績等。企業在設計商業秘密管理組織時需將相關的影響因素皆納入考量。
在此。我們依據企業的規模，提出企業可採用的三種管理組織形式，以供參考。
在該架構中，2000人以上的企業可參考A形式;
2000人以下及1000人以上的企業，可參考B形式;
1000人以下的企業可參考C形式。
這些門檻數字並非絕對，企業仍需依據其特性作出最終的決策，接下來我們將對每種形式的組織架構進行說明。
A:對大型企業而言，健全完整分配各種商業秘密管理角色並不是難事。事實上每種形式都因架構而變化。以商業秘密管理總召集人(以下簡稱總召集人)為首，帶領商業秘密管理委員會(以下簡稱委員會)，共同討論並決策與商業秘密管理相關的事宜。而商業秘密管理執行秘書，(以下簡稱執行秘書)，咋負責管理委員會的相關事物時，委員會順利運作。此外，執行秘書下亦有一群幕僚人員，稱為商業秘密管理執行小組，(以下簡稱執行小組)負責商業秘密管理制度的日常維護。
商業秘密設管理涉及全企業，若要讓商業秘密管理制度運作順利，企業各部門的參與是非常關鍵的。建議各部門至少推派一名種子人員，以協助執行秘書適當的執行和傳達與商業秘密管理相關事宜。
此外，商業秘密管理制度是否被完全落實，是否需要進行調整等議題，企業應使用完善的內部稽核程式來回答。為了保持稽核的獨立性，內部稽核負責人及成員，應直接對總召集人彙報，最後當商業秘密受侵害時，應有經訓練、熟知緊急應變計劃的商業秘密侵害事件緊急應變組，(以下簡稱應變組)接手處理。應變組內又可依其功能細分不同的角色。
建議，可設立事件管理、調查評估、溝通協調及公關媒體等角色，以協助企業彙整與管理、調查、跨部門溝通及時對外說明商業秘密侵害事件的來由與處置對策。
B:完整的商業秘密管理制度應遵循PDCA原則，確認制度是否被落實是必經過程之一，因此建議將稽核的角色配置於執行小組中。在既有的組織架構下，由執行秘書提出建議，經委員會核准，尋找並培養具備稽核專業知識且擁有技術及產業知識的人員擔任稽核的角色，其他的角色則與A形式的管理組織相同。
C:C適用於小型企業，企業組織架構較單純和彈性較大者，C形式的管理組織其稽核功能配置在執行小組中，企業無專職的稽核部門。同時企業亦未有預先設立的應變組織，僅設有應變視窗，待事件發生後，視情況調配相關權責人員進行處理。
除組織架構外，由誰來擔任各種角色，亦是企業常見的困擾，結合過往的經驗彙總，並提出角色指派的以下建議:
1.商業秘密管理總召集人:至少為副總經理級別以上職位的人員擔任，例如:董事長、總經理、人力資源部總經理、法務部總經理等;
2.商業秘密管理委員會:由企業主要事業單位、部門及工廠的最高主管組成;
3.內部稽核負責人:由公司稽核部門主管擔任;
4.商業秘密管理執行秘書:為企業的商業秘密管理代表可能的人選為總經辦、人力資源部門、法務部門等部門的人員;
5.商業秘密管理執行小組:由委員會指派溝通能力好的人員，協助執行秘書推動各項商業秘密管理制度工作，最終由總召集人任命。設定人員數量應根據企業規模決定。
6.商業秘密管理實行部門/工廠:實行部門/工廠負責人為部門和工廠的最高主管，主要負責審閱與核准相關的商業秘密管理制度檔案及表單，並指派部門和工廠的種子人員，而種子人員，由熟悉該部門和工廠業務的人員擔任尤佳。種子人員的年資至少大於一年，並具有一定的責任感與熱枕。
7.商業秘密侵害事件緊急應變組:應變處理小組召集人員由委員會推派人員擔任。亦為事件應變的單一視窗，可由法務部門、人資部門、管理部門等部門的主管擔任。而應變組的每個分組則由應變組召集人指派人員擔任組長。應變組的成員應包含發生侵害事件的權責部門及相關配合部門。
建立合適的商業秘密管理組織，絕對是商業秘密管理制度的成功要素之一，不論使用何種形式的管理組織，只要建立在管理組織具備了角色權責分配得宜、任務執行獲高層主管支援、實施者對任務有相應保證等條件，所有推動管理制度實施的行動勢必事半功倍。