龍眼樹體大，單株產量高，大小年結果明顯，施肥顯得特別重要。龍眼施肥根據其產量來確定，一般生產100千克新鮮的果實，需氮肥（N）2千克、磷肥（P2O5）1千克、鉀肥（K2O）2千克。分三個時期施用：①採果肥。在採果前後施用，氮肥佔全年的40%，磷肥佔30%～40%，鉀肥佔25%～40%，有機肥與無機肥配合施用，其中有機肥（土雜肥等）每株可施150～200千克，這次施肥可以迅速恢復樹勢，促進秋梢抽生和發育，積累養分，為來年花芽分化打下基礎；②花前期。這次施肥氮、鉀肥各佔全年的20%～25%，磷肥佔30%。分別在抽穗前（立春前後）和開花前（清明至穀雨間）分兩次施用。前者可提高抽穗率、壯實花穗；後者，可提高坐果率，促進夏梢抽生；③幼果肥。主要以鉀肥為主，佔全年的40%～50%，氮磷肥各佔25%～40%。分兩次施用，一次在幼果形成期（夏至）施用，以減少落果，促進幼果發育和夏梢結果枝壯實。另一次在膨果期（大暑至立秋）施用，以促進果實膨大，減少採前落果。結果期間還可葉面噴施0.5%尿素、0.2%磷酸二氫鉀、0.2%～0.3%硝酸鎂或硝酸鈣，以及0.1%～0.2%硼砂，以補充養分的不足。

經對養分吸收動態研究發現，龍眼在2月開始吸收氮、磷、鉀等養分，6、8月出現兩次吸收高峰。

其中果實對氮磷的吸收從5月份漸增，分別在7月和8月出現最高峰，6～9月是龍眼周年中吸收肥料養分最多的時期。

科學平衡施肥是實現龍眼高產、穩產、優質的關鍵措施。

龍眼的施肥應根據樹體營養生理特性、肥料種類、氣候環境條件及其他管理條件綜合考慮制訂計劃方案。

幼齡施肥應以利於促進根發育和樹冠迅速擴充套件為目的，一般實行“一梢兩肥”較好。

在萌芽前施促芽肥，在新梢開始轉綠時施壯梢肥並結合噴施葉面肥（根外追肥）。結果樹施肥應主要圍繞培育優良秋梢結果母枝、促進花芽分化和壯大果實三方面進行，一般分採果肥、促花肥和壯果肥3次施用。