1、傳代保藏 傳代保藏菌種是微生物儲存中最常用的方法之一。很多微生物在低溫或者乾燥處理時，會很快死亡，為了儲存菌種的活性，就要定期不斷的進行菌種轉接、培養後再儲存。
2、斜面低溫保藏 將待保藏的菌種接種在合適的斜面培養基上，在相應的條件下培養至得到充足的菌體或者孢子，隨後密封試管置於4℃左右儲存，具體儲存溫度按照儲存菌種設定。保藏時間依微生物的種類從1個月到4個月不等。
3、冷凍乾燥保藏 冷凍乾燥保藏法為菌種保藏方法中最有效的方法之一，對一般生活力強的微生物及其孢子以及無芽胞菌都適用，這種方法適用於菌種長期儲存，一般可儲存數年至十餘年。中國大多數生物製品菌種都是採用該法保藏。
4、半固體穿刺保藏 配製半固體培養基，高壓溼熱滅菌後倒於無菌試管中至約1/3，待培養基凝固，用接種環從平面培養基上挑取單菌落，穿入培養基若干次。在合適的條件下進行培養至菌體旺盛生長，之後密封試管，根據菌種特點在4 ℃左右或者涼爽乾燥處儲存。儲存時間至少可以達到1 年，對於有些菌種甚至能達到20 年之久。
5、液氮超低溫保藏 液氮超低溫保藏法是菌種長期保藏的最有效最可靠的方法。液超低溫保藏法是把菌種裝在含有冷凍保護劑的安瓶瓶內，將該安瓶瓶放人液氮（-196℃）中保藏。
6、冷凍真空乾燥保藏 將處於成熟期的微生物培養物懸浮於無菌的血清、卵白、脫脂奶或者海藻糖等保護劑中製成濃菌液，分裝到無菌的安瓿瓶中，於低溫冰箱中冷凍，達到預定溫度後對濃菌液進行冷凍乾燥處理，之後在真空狀態下融封安瓿瓶，於20 ℃保藏。
7、蒸餾水保藏 蒸餾水保藏菌種的方法普遍的應用於醫學微生物、食品微生物和工業微生物中。將菌體懸浮於蒸餾水中，即可在室溫下儲存數年，此法應注意避免水分的蒸發。
1、傳代保藏 傳代保藏菌種是微生物儲存中最常用的方法之一。很多微生物在低溫或者乾燥處理時，會很快死亡，為了儲存菌種的活性，就要定期不斷的進行菌種轉接、培養後再儲存。
2、斜面低溫保藏 將待保藏的菌種接種在合適的斜面培養基上，在相應的條件下培養至得到充足的菌體或者孢子，隨後密封試管置於4℃左右儲存，具體儲存溫度按照儲存菌種設定。保藏時間依微生物的種類從1個月到4個月不等。
3、冷凍乾燥保藏 冷凍乾燥保藏法為菌種保藏方法中最有效的方法之一，對一般生活力強的微生物及其孢子以及無芽胞菌都適用，這種方法適用於菌種長期儲存，一般可儲存數年至十餘年。中國大多數生物製品菌種都是採用該法保藏。
4、半固體穿刺保藏 配製半固體培養基，高壓溼熱滅菌後倒於無菌試管中至約1/3，待培養基凝固，用接種環從平面培養基上挑取單菌落，穿入培養基若干次。在合適的條件下進行培養至菌體旺盛生長，之後密封試管，根據菌種特點在4 ℃左右或者涼爽乾燥處儲存。儲存時間至少可以達到1 年，對於有些菌種甚至能達到20 年之久。
5、液氮超低溫保藏 液氮超低溫保藏法是菌種長期保藏的最有效最可靠的方法。液超低溫保藏法是把菌種裝在含有冷凍保護劑的安瓶瓶內，將該安瓶瓶放人液氮（-196℃）中保藏。
6、冷凍真空乾燥保藏 將處於成熟期的微生物培養物懸浮於無菌的血清、卵白、脫脂奶或者海藻糖等保護劑中製成濃菌液，分裝到無菌的安瓿瓶中，於低溫冰箱中冷凍，達到預定溫度後對濃菌液進行冷凍乾燥處理，之後在真空狀態下融封安瓿瓶，於20 ℃保藏。
7、蒸餾水保藏 蒸餾水保藏菌種的方法普遍的應用於醫學微生物、食品微生物和工業微生物中。將菌體懸浮於蒸餾水中，即可在室溫下儲存數年，此法應注意避免水分的蒸發。