這種育種也叫三系雜交。隨著中國勞動力成本的增長,辣椒制種成本也愈來愈高,再加上繁種市場的不規範,親本流失情況越來越嚴重,越來越多的單位開始研究辣椒三系雜交制種技術,來保護親本,降低制種成本。
利用雄性不育系繁殖一代雜種，可以避免人工去雄所 需的大量勞力，而且避免了去雄不及時、不徹底所造成的假 雜種。
利用細胞質遺傳的雄性不育系制種時至少需要兩個隔離區，即親本（兩用系和恢復系）留種區和雜交種子制種區。(1)兩用系和恢復繫留種區：在隔離區內種植雄性不育兩用系，用兩用系中的50%不育株作母本，兩用系中的50%可育株作父本，進行人工輔助授粉，從50%不育株採收的種子仍為兩用系，供配製一代雜種及自身繁殖用。
另50%可育株在完成授粉後種子成熟前全部拔除。在另一隔離區內種植恢復系，自交採種即可。十九、竦椒採種技術(2)雜交種子制種區：在此區內繁殖一代雜交種。以兩用係為母本、恢復系作父本，按（6~8) : 1種植，母本開花前或開花初期徹底拔除其中的50%可育株。
以兩用系中留下的50%不育株為母本，花期人工輔助雜交，從不育繫上釆收的種子為一代雜種，供生產使用。 父本系上採收的自交種子仍為父本系，供下輪配製雜種用及自身繁殖用（實際當前制種中均將父本在授粉結束後拔除）。兩個隔離區的其他管理方法與人工去雄授粉的相同。
這種育種也叫三系雜交。隨著中國勞動力成本的增長,辣椒制種成本也愈來愈高,再加上繁種市場的不規範,親本流失情況越來越嚴重,越來越多的單位開始研究辣椒三系雜交制種技術,來保護親本,降低制種成本。
利用雄性不育系繁殖一代雜種，可以避免人工去雄所 需的大量勞力，而且避免了去雄不及時、不徹底所造成的假 雜種。
利用細胞質遺傳的雄性不育系制種時至少需要兩個隔離區，即親本（兩用系和恢復系）留種區和雜交種子制種區。(1)兩用系和恢復繫留種區：在隔離區內種植雄性不育兩用系，用兩用系中的50%不育株作母本，兩用系中的50%可育株作父本，進行人工輔助授粉，從50%不育株採收的種子仍為兩用系，供配製一代雜種及自身繁殖用。
另50%可育株在完成授粉後種子成熟前全部拔除。在另一隔離區內種植恢復系，自交採種即可。十九、竦椒採種技術(2)雜交種子制種區：在此區內繁殖一代雜交種。以兩用係為母本、恢復系作父本，按（6~8) : 1種植，母本開花前或開花初期徹底拔除其中的50%可育株。
以兩用系中留下的50%不育株為母本，花期人工輔助雜交，從不育繫上釆收的種子為一代雜種，供生產使用。 父本系上採收的自交種子仍為父本系，供下輪配製雜種用及自身繁殖用（實際當前制種中均將父本在授粉結束後拔除）。兩個隔離區的其他管理方法與人工去雄授粉的相同。