北京航空航天大學有60多個本科專業。最好的專業，電子資訊工程、通訊工程、軟體工程、飛行器設計與工程、飛行器動力工程、數學與應用數學、機械工程及自動化、材料科學與工程、電氣工程及其自動化、測控技術與儀器、探測制導與控制技術，這些專業都是國家級特色專業。

(1) 材料科學與工程系，有一個專業類：材料科學與工程類，含金屬材料、電子資訊材料、金屬腐蝕與防護，高分子與複合材料，材料加工五個專業方向。

(2) 電子資訊工程系，有1個專業類：無線電工程類，含微波技術與天線、導航、雷達、遙控遙測4個專業。

(3) 自動控制系，有2個專業類：航空自動控制類，含飛行器自動控制、航空陀螺與慣性導航、航空電器工程、航空儀表與測試4個專業；流體控制與操縱系統類，含流體控制與操縱系統1個專業。?

(4) 發動機系，有1個專業類：發動機設計類，含航空渦輪噴氣發動機、固體火箭發動機2個專業。?

(5) 飛行器設計與應用力學系，有2個專業類：飛行器設計類，含飛機設計、有翼導彈設計、高空裝置3個專業；航空工程力學類，含固體力學、空氣動力學、飛行力學3個專業。

(6) 計算機科學與工程系，有1個專業類：計算機科學與工程類，含電子計算機、計算機 軟體2個專業。

(7) 機械製造工程系，有1個專業類：航空製造工程類，含航空焊接工程、飛行器製造工程、機械加工工程、機械製造自動控制工程4個專業。

(8) 生物工程系；現有生物工程本科專業和生物醫學工程一級學科碩、博士點，擁有生物醫學工程博士後流動站。