1、概念不同。歐盟國是指一個經濟共同體，貨幣除了歐元區外，歐盟其它成員將會繼續使用本國的貨幣，比如英國和丹麥；而申根國是指邊境協議，申根國家之間取消邊境管制。

2、成員不同。歐盟共有28個成員國，法國、德國、義大利、荷蘭、比利時、盧森堡為創始成員國，於1951年結盟。此後，丹麥、愛爾蘭、英國（包括直布羅陀）（1973年），希臘（1981年），西班牙和葡萄牙（1986年），奧地利、芬蘭、瑞典（1995年）先後成為歐盟成員國。

2004年5月1日，歐盟實現了有史以來規模最大的擴盟，波蘭、捷克、匈牙利、斯洛伐克、斯洛維尼亞、塞普勒斯、馬耳他、拉脫維亞、立陶宛和愛沙尼亞十個國家同時加入歐盟。2007年1月1日，保加利亞和羅馬尼亞加入歐盟。2013年7月1日，克羅埃西亞入盟。

此外，歐盟還啟動了與冰島的入盟談判；將土耳其、馬其頓、黑山、阿爾巴尼亞、塞爾維亞列為歐盟候選國。

申根國家有奧地利、比利時、丹麥、芬蘭、法國、德國、冰島、義大利、希臘、盧森堡、荷蘭、挪威、葡萄牙、西班牙、瑞典、匈牙利、捷克、斯洛伐克、斯洛維尼亞、波蘭、愛沙尼亞、拉脫維亞、立陶宛、馬耳他、瑞士和列支敦斯登。

3、成立原因不同。歐盟成立原因：謀求統一是歐洲政治家長期的願望。歐洲的國家有共同的地域，語言上有相通性，而且有共同的文化傳統和價值觀。兩極格局。歐洲和蘇聯格格不入，同時又受到美國的控制，為了擺脫這種局面，各國走向聯合。

西歐各國普遍較小，為了適應第三次科技革命的需要，各國須擴大市場，打破阻礙經濟發展的桎梏，才能進一步促進歐洲經濟發展。

申根國成立原因：取消相互之間的邊境檢查點，並協調對申根區之外邊境控制。就是在成員國家之間取消邊境管制，持有任意成員國有效身份證或簽證人可以在所有成員國境內自由流動。根據該協定，旅遊者如果持有其中一國的有效簽證即可合法地到所有其他申根國家參觀。