火箭隊：基本算是常常出現，以搶小智的皮卡丘為目的，隊內人物有武藏，小次郎，喵喵。
銀河隊：神奇寶貝鑽石珍珠裡出現在神和鎮（第96集~第97集），跟著夥星、歲星和鎮星出現。控制了神奧的許多產業。看似和善熱心同時也在積極打聽小智和小光看見湖之神奇寶貝的事情，但是小智和其他人不知道他是銀河隊的頭目。片尾部分表明他實際上是銀河隊頭目的真實身份。
獵人J：神奇寶貝鑽石珍珠裡的神奇寶貝獵人，與眾多手下組成非法的捕獵團，經非法方式捕捉神奇寶貝後，一般會進行交易或作個人收藏之用。她的行動也多次遭到小智等人的阻止。後來和銀河隊聯手，企圖捕捉神奧三大湖中的傳說中的神奇寶貝艾姆利多、由克希和亞克諾姆。最終她和她的飛船在立志湖墜毀了，從此下落不明。
火巖隊：火巖隊是神奇寶貝超世代裡出現的。首領火焰松性格與水梧桐對比鮮明，自由奔放大膽。實力難以忽視，與水梧桐勢均力敵。企圖操縱超古代神奇寶貝固拉多增加陸地面積，卻被操控用的寶珠控制。在脫離了寶珠的控制之後，決定與水梧桐一起打倒面前所有的阻礙征服世界。最後與水梧桐一起坐米可利的氣墊車逃走，結果被強大的電流擊中，身體瀕臨崩潰。此時，火箭隊三獸士之一薩奇出現，提供一套可維持生命的盔甲，但盔甲只有一套。水火二人即做生死對決。結果赤焰松失敗，由水梧桐領取盔甲。
水艦隊：水艦隊也是神奇寶貝超世代中出現的。首領水梧桐個性冷靜，同時冷酷無情。以電視臺上層人員為名目，企圖找出超古代PM蓋歐卡，並操縱它增加海洋麵積。在脫離了超古代PM的控制之後重奪寶珠，決定與赤焰松一起打倒面前所有的阻礙征服世界，但陰謀被雪拉比粉碎，並使身體處於崩潰邊緣，薩奇給予他一件可以維持生命的神秘盔甲。及後第六章以“盔甲男”身份再度登場，並利用基拉祈來實現擴張海洋一夢，最終在圖鑑持有者們的反擊下失去盔甲，賠上性命，臨死前向米拉特道出幕後黑手——銀河隊。
火箭隊：基本算是常常出現，以搶小智的皮卡丘為目的，隊內人物有武藏，小次郎，喵喵。
銀河隊：神奇寶貝鑽石珍珠裡出現在神和鎮（第96集~第97集），跟著夥星、歲星和鎮星出現。控制了神奧的許多產業。看似和善熱心同時也在積極打聽小智和小光看見湖之神奇寶貝的事情，但是小智和其他人不知道他是銀河隊的頭目。片尾部分表明他實際上是銀河隊頭目的真實身份。
獵人J：神奇寶貝鑽石珍珠裡的神奇寶貝獵人，與眾多手下組成非法的捕獵團，經非法方式捕捉神奇寶貝後，一般會進行交易或作個人收藏之用。她的行動也多次遭到小智等人的阻止。後來和銀河隊聯手，企圖捕捉神奧三大湖中的傳說中的神奇寶貝艾姆利多、由克希和亞克諾姆。最終她和她的飛船在立志湖墜毀了，從此下落不明。
火巖隊：火巖隊是神奇寶貝超世代裡出現的。首領火焰松性格與水梧桐對比鮮明，自由奔放大膽。實力難以忽視，與水梧桐勢均力敵。企圖操縱超古代神奇寶貝固拉多增加陸地面積，卻被操控用的寶珠控制。在脫離了寶珠的控制之後，決定與水梧桐一起打倒面前所有的阻礙征服世界。最後與水梧桐一起坐米可利的氣墊車逃走，結果被強大的電流擊中，身體瀕臨崩潰。此時，火箭隊三獸士之一薩奇出現，提供一套可維持生命的盔甲，但盔甲只有一套。水火二人即做生死對決。結果赤焰松失敗，由水梧桐領取盔甲。
水艦隊：水艦隊也是神奇寶貝超世代中出現的。首領水梧桐個性冷靜，同時冷酷無情。以電視臺上層人員為名目，企圖找出超古代PM蓋歐卡，並操縱它增加海洋麵積。在脫離了超古代PM的控制之後重奪寶珠，決定與赤焰松一起打倒面前所有的阻礙征服世界，但陰謀被雪拉比粉碎，並使身體處於崩潰邊緣，薩奇給予他一件可以維持生命的神秘盔甲。及後第六章以“盔甲男”身份再度登場，並利用基拉祈來實現擴張海洋一夢，最終在圖鑑持有者們的反擊下失去盔甲，賠上性命，臨死前向米拉特道出幕後黑手——銀河隊。