南瓜由於貯藏時間長，是北方人喜歡吃的蔬菜之一，近幾年栽植面積逐漸上升。但是，南瓜成熟前果頂腐爛會直接導致南瓜坐果失敗，影響南瓜的產量。

南瓜喜旱不耐澇，土壤排水不暢，會導致地表積水，加上南瓜葉片的遮擋，在南瓜附近會形成一個“相對密閉”的空間。再加上太Sunny照和植物的蒸騰作用，在南瓜附近形成一個高溫、高溼、密閉的環境，南瓜在這種環境下表組織運輸困難，會誘發腐爛病。腐爛位置多為南瓜表面、果頂、甚至莖葉。這種腐爛一般不會大面積傳染。

解決辦法：選擇透水性好的沙質土或者沙壤土栽植南瓜；澆水次數不宜頻繁，待地表2cm為乾土時方可澆水；人工適當剪除南瓜附近的葉片，保證南瓜附近空氣流通。還可以在南瓜地下鋪砂礫或者稻草，避免南瓜腐爛。

疫病是南瓜常見的病蟲害之一。主要病症是南瓜表面、莖葉（含果頂）出現白色黴狀物，進而變灰，直至黑色。對於出現這種病害的南瓜和莖葉要砍除，及時防治，不然會蔓延開來，造成更大面積的腐爛，帶來經濟損失。

解決辦法：農藥防治：用25％甲霜靈配比600倍液或者使用用疫黴靈配800～1000倍液人工噴灑，對於染病的南瓜要及時清理。

連續陰天造成空氣溼度變大，南瓜在高溼度的環境下容易“返綠”，或者腐爛。連續陰天會導致南瓜不生長，產量降低。

解決辦法：在南瓜地穴狀放置碳灰或者生石灰。