虎門高鐵站位於虎門白沙，省道S256以東、廣深高速西面，是廣深港高鐵在東莞的唯一車站。虎門站為3層結構，一樓是售票廳、二樓是站廳層，三樓是站臺層。其中一、二樓位於鐵路橋下，三樓站臺則位於鐵路橋上，為高架雨棚。據悉，站房建築面積1萬餘平方米，頂部為站臺和6車道的火車軌道。站臺雨棚建築面積近3萬平方米。站臺離地面超過22米，雨棚最高點接近40米，被稱為“空中火車站”。 　　根據早前公佈的首批公交配套線路，東莞市新通運輸有限公司經營的3條公交路線，將進行調整，成為兩條虎門站直達線路，而且線路編號也改變了，新線路分別命名為公交快線18路線和公交快線19路線。調整後取消原123路線，201路線使用剩餘36輛運力繼續運營。其中，原線路123路線，更改為公交快線18路線，首末站也由原來的汽車東站至虎門客運站，更改為市汽車客運站（即位於萬江的汽車總站）至虎門白沙公交樞紐站，投入車輛數為14輛；原線路123路線和201路線，合併為公交快線19路線，新線路將從汽車東站至虎門白沙公交樞紐站，投入車輛數為20輛。 　　還有，沙田也開通一條直達公交線路，原沙田公汽4路調整為穗豐年站至虎門白沙公交樞紐站，投入15輛車營運。 　　此外，交通部門還公佈了途經高鐵虎門站的23條跨鎮公交線路，包括67路、67A路、107路、112路、112A路、113路、115路、118路、120路、201路、205路、211路、213路、310路、L1路等，市民坐這些線路都可以到達高鐵虎門站。