故事發生於七龍珠Z 5年後的世界，早於先代天神和魔王比克分體前，其即創造了黑星龍珠。每當它完成心願後的黑星龍珠會散佈於宇宙各處，要是一年內無法集齊七粒黑星龍珠在一起的話，最初許願的星球便會被自體毀滅。自龍珠故事開篇即開始找尋七龍珠的皮拉夫及眾手下設法找到了黑星龍珠，於許願時誤會地許了使悟空變回小孩子的願望，願望實現後黑星龍珠四散宇宙中。後來，悟空和現代特蘭克斯、孫女BoBo(小芳)一同乘宇宙飛船到宇宙中找尋黑星龍珠以拯救地球，途中由於一個高智慧機器人吉魯將龍珠雷達以食物消化，其以機器及鐵製品為食，具有將一切食物之用途化為己用的能力，故本領高強，擁有很大提升空間。吉魯原本是罪犯星球的罪犯手下，後改邪歸正，助眾人尋找黑星龍珠，成為眾人戰友，其多次毀壞均被眾人修復及再造，後其與眾人一同於地球居住。 超級17號篇後，悟空等人打算找尋地球龍珠讓地球復原，可這次地球龍珠卻呼喚出了邪惡龍。由於地球龍珠從開始至今使用了太多，負向能源讓地球龍珠變壞。悟空自告奮勇去打倒七條邪惡龍以恢復地球龍珠原貌。孫悟空一行人幾經辛苦，消滅了六條邪惡龍並使其復原，而一星龍最難對付，其於戰勝不了超越超級賽亞人四的悟空而集合所有龍珠，將其重新變成邪惡龍並以其力量變身為超級一星龍，原來所有復原的地球龍珠一旦讓其控制便會以負向能源邪惡龍的形態重新復活。戰鬥中奇妙的是四星龍因被悟空從超級一星龍手中奪得吞下淨化後竟然成了眾人的幫幫手，可後來其身體因被超級一星龍霸佔而使其逃過一劫。之前於眾人掩護下悟空與貝吉塔以超級賽亞人四融合對敵，其力量可抵抗集合所有龍珠以其力量變身的超級一星龍。後融合後的悟吉塔由於貪玩能源不足導致分開，只傷至一星龍吸收除四星球以外龍珠的非完全體，四星龍被悟空感化而對抗一星龍未果被吸收。此後悟空和貝吉塔亦想過重新融合未果，一星龍看悟空等大勢已去想毀滅地球，悟空一心想保護地球犧牲了自己。此後貝吉塔等想做最後掙扎被打敗，之後悟空靈魂設法集結了全宇宙的元氣合成元氣彈，一星龍被元氣彈殺死後，所有地球龍珠的能量這次都得以成功淨化了。地球神龍於大戰後以無人呼叫下亮天突然出現，其將地球與眾人回覆面貌後便帶同悟空離開並且滿足其願望（看望其三個良師益友~龜仙人、小林和短笛）和恢復其成人之身；最後悟空來到若干年後的天下第一武道會，見孫女小芳已老去，同名曾孫-孫悟空jr和貝吉塔之曾孫貝吉塔jr在戰鬥，悟空甚感欣慰，後因不想被認出而離去。畫面最後大大的THE-END告訴觀眾悟空的故事到此結束了。