1、流轉方式不同電子支付是採用先進的技術透過數字流轉來完成資訊傳輸的，其各種支付方式都是透過數字化的方式進行款項支付的；而傳統的支付方式則是透過現金的流轉、票據的轉讓及銀行的匯兌等物理實體來完成款項支付的。

2、支付媒介不同電子支付使用的是最先進的通訊手段，如Internet、Extranet，而傳統支付使用的則是傳統的通訊媒介；電子支付對軟、硬體設施的要求很高，一般要求有聯網的微機、相關的軟體及其他一些配套設施，而傳統支付則沒有這麼高的要求。

3、用時和費用不同傳統支付費用高，電子支付費用低。電子支付具有方便、快捷、高效、經濟的優勢。使用者只要擁有一臺上網的PC機，便可足不出戶，在很短的時間內完成整個支付過程。在電子商務中，支付過程是整個商貿活動中非常重要的一個環節，同時也是電子商務中準確性、安全性要求最高的業務過程。電子支付的資金流是一種業務過程,而非一種技術。但是在進行電子支付活動的過程中,會涉及到很多技術問題。傳統支付方式普遍使用的是發票、本票、匯票、信用卡、現金的方式，雖然以票據交換取代了現金流轉，給實際支付業務帶來了巨大的變化，但是，這種方式下的業務處理仍然存在著許多弊病。現今採用網路交易的電子支付不僅能夠提高結算效率，更重要的是加快了資金週轉速度，降低了資金週轉的成本。