水井流進了雨水、洪水或汙水後，新挖或是清洗的時候，都需要對井水進行消毒。根據水源特點，既可以在井處消毒，也可以在用水端進行終端消毒，有些情況下井處消毒無濟於事，只能進行終端消毒。根據井水的用途，可以採用傳統的化學劑消毒，也可以採用淨水裝置消毒。
方法/步驟
新挖的水井，只要水質沒有問題，水源沒被汙染，一般不需要消毒的，只有在挖井的時候汙染了井壁，以及井壁建築材料帶有害浮塵的情況下，才需要消毒。在消毒前，先用清水洗淨井壁，然後抽乾汙濁的泥漿水，等水井恢復滿水狀態後，按每立方米水量投放1千克的量投放明礬等絮凝劑。絮凝劑浸泡24小時，然後抽乾水,等待水井恢復滿水位後，再按每立方米水量投0.5千克的量投放漂白粉等消毒殺菌劑，浸泡24小時，然後抽乾水井，反覆滿水抽乾三次以上。
如果是水泥澆築的井壁，消毒後也不能立即食用井水，最好浸泡一個月以上，期間不斷重複滿水抽乾操作，以洗去水泥浮沉，除去水泥味。
需要注意的是，消毒用的絮凝劑和殺菌劑，千萬不可圖便宜採用工業類的，一定購買生活用的。
如果是密封的水井經常抽上來青苔，很多人會誤以為水井裡長苔蘚了（當然，也可能長青苔，但可能性不大），錯誤地對井水殺菌，其實是管道的積水處長青苔了，髒水管汙染了井水，需要清洗管道了。堵住水管的井端，然後往水管裡灌白醋，灌滿後浸泡水管24小時，最後把白醋排出，抽水沖刷水管即可。
如果水源處被汙染了，在水井處進行消毒殺菌，是無濟於事的，殺菌一次新水來了還是一樣的帶病菌，因此，這種情況在用水端消毒殺菌更有利。非直接飲用的生活用水，用漂白粉等殺菌劑消毒即可。
需要注意的是，間接食用的水一定要選用食品級消毒劑，嚴格按照說明使用消毒劑的量，投放消毒劑後，最好讓水在敞口的容器裡靜置24小時以上，讓餘氯等揮發掉。
如果是直接飲用的水，則最好在用水端用淨水消毒器等淨水裝置進行消毒殺菌。淨水器的濾芯和濾膜要按規定經常清洗或更換，否則達不到消毒效果。
也可以用在用水端採用高溫消毒。高溫消毒的一個方法是煮沸幾分鐘，但不能長時間煮沸，那樣對健康不利。此外，如果是夏天高溫季節，家有太陽能熱水器等裝置，則可以把井水裝到太陽能熱水器裡，讓太陽把井水曬沸騰，然後放出到乾淨容器裡，繼續換水曬開，這樣就能省能源能量，又能殺菌。
為了方便水井處和用水端都能消毒，且免去普通消毒殺菌的各種麻煩及副作用，可以採用生活飲用水紫外線消毒器進行消毒殺菌。這個消毒成本高，但只需一次投入，免去日常消毒操作的種種麻煩。
水井流進了雨水、洪水或汙水後，新挖或是清洗的時候，都需要對井水進行消毒。根據水源特點，既可以在井處消毒，也可以在用水端進行終端消毒，有些情況下井處消毒無濟於事，只能進行終端消毒。根據井水的用途，可以採用傳統的化學劑消毒，也可以採用淨水裝置消毒。
方法/步驟
新挖的水井，只要水質沒有問題，水源沒被汙染，一般不需要消毒的，只有在挖井的時候汙染了井壁，以及井壁建築材料帶有害浮塵的情況下，才需要消毒。在消毒前，先用清水洗淨井壁，然後抽乾汙濁的泥漿水，等水井恢復滿水狀態後，按每立方米水量投放1千克的量投放明礬等絮凝劑。絮凝劑浸泡24小時，然後抽乾水,等待水井恢復滿水位後，再按每立方米水量投0.5千克的量投放漂白粉等消毒殺菌劑，浸泡24小時，然後抽乾水井，反覆滿水抽乾三次以上。
如果是水泥澆築的井壁，消毒後也不能立即食用井水，最好浸泡一個月以上，期間不斷重複滿水抽乾操作，以洗去水泥浮沉，除去水泥味。
需要注意的是，消毒用的絮凝劑和殺菌劑，千萬不可圖便宜採用工業類的，一定購買生活用的。
如果是密封的水井經常抽上來青苔，很多人會誤以為水井裡長苔蘚了（當然，也可能長青苔，但可能性不大），錯誤地對井水殺菌，其實是管道的積水處長青苔了，髒水管汙染了井水，需要清洗管道了。堵住水管的井端，然後往水管裡灌白醋，灌滿後浸泡水管24小時，最後把白醋排出，抽水沖刷水管即可。
如果水源處被汙染了，在水井處進行消毒殺菌，是無濟於事的，殺菌一次新水來了還是一樣的帶病菌，因此，這種情況在用水端消毒殺菌更有利。非直接飲用的生活用水，用漂白粉等殺菌劑消毒即可。
需要注意的是，間接食用的水一定要選用食品級消毒劑，嚴格按照說明使用消毒劑的量，投放消毒劑後，最好讓水在敞口的容器裡靜置24小時以上，讓餘氯等揮發掉。
如果是直接飲用的水，則最好在用水端用淨水消毒器等淨水裝置進行消毒殺菌。淨水器的濾芯和濾膜要按規定經常清洗或更換，否則達不到消毒效果。
也可以用在用水端採用高溫消毒。高溫消毒的一個方法是煮沸幾分鐘，但不能長時間煮沸，那樣對健康不利。此外，如果是夏天高溫季節，家有太陽能熱水器等裝置，則可以把井水裝到太陽能熱水器裡，讓太陽把井水曬沸騰，然後放出到乾淨容器裡，繼續換水曬開，這樣就能省能源能量，又能殺菌。
為了方便水井處和用水端都能消毒，且免去普通消毒殺菌的各種麻煩及副作用，可以採用生活飲用水紫外線消毒器進行消毒殺菌。這個消毒成本高，但只需一次投入，免去日常消毒操作的種種麻煩。