生競黨回答:第一，真核生物的轉錄不只有發生在細胞核裡。除了其他答主提到的兩個半自主細胞器:線粒體（mitochondrion）和葉綠體（chloroplast）。我們還需要注意的是:（敲黑板）逆轉錄病毒和DNA病毒也在細胞核內轉錄，原因是DNA病毒複製借用宿主的酶系，而DNA聚合酶有核定位訊號（NLS），經核糖體翻譯出來後會經核孔複合體（NPC）介導下入核，因此在有絲分裂間期不會長期存在轉錄相關酶。但是M期核膜崩解了就不一定了，沒有核膜的約束，基質裡肯定會存在大量RNA聚合酶。核膜消失後減數第一次分裂前期的雙線期同樣存在DNA大量轉錄，同時會形成特殊的袢環結構。不過分裂末期核膜再次形成時核孔複合體會逐個把細胞核蛋白回收，因為核定位訊號在蛋白質內部，加工後不被切去且非常穩定。第二，有義鏈與模板鏈只是相對而言。轉錄時，一次只轉錄一條鏈（即不對稱轉錄），轉錄哪條只和DNA上的順式作用元件有關，簡單理解就是，啟動子的強弱決定轉錄的頻率。而啟動子的強弱與該啟動子與啟動子一致序列的相似度直接相關。第三個問題問了什麼，反正我沒看懂。原核生物轉錄的終止有兩種機制:1、非pho因子依賴型/簡單終止在終止區出現富含GC的迴文序列，迴文序列下游有多聚U序列。富含GC的迴文序列可以自主形成莖環結構（鏈內配對），可以停頓RNA聚合酶的移動與促進轉錄泡的坍縮，多聚U可形成的氫鍵較弱，可以鬆弛RNA聚合酶與模板鏈的結合促進解聚。2、pho因子依賴型這種模式為噬菌體常用。這種情況下轉錄物的5"端存在pho因子利用位點（nut），pho因子可以結合到轉錄物的5"端，利用自身ATPase活性向3"端移動，當其追上暫停於終止區的聚合酶時，其利用自身解鏈酶活性解開雜交雙鏈，釋放出hnRNA和RNA聚合酶。真核生物的轉錄終止:更接近簡單終止型，不同之處是沒有莖環結構的形成。注意真核生物有可變加尾的特徵，終止區通常有加尾訊號。以上，題主的分子生物學還需努力。所有資料來自《生物化學原理》第二版，作者是本人偶像楊榮武教授。想看故事版的DNA轉錄歡迎移步我的另一個回答。（不會貼連結，請知乎搜尋“孤獨的聚合酶”）這麼幹貨的回答留個讚唄~
生競黨回答:第一，真核生物的轉錄不只有發生在細胞核裡。除了其他答主提到的兩個半自主細胞器:線粒體（mitochondrion）和葉綠體（chloroplast）。我們還需要注意的是:（敲黑板）逆轉錄病毒和DNA病毒也在細胞核內轉錄，原因是DNA病毒複製借用宿主的酶系，而DNA聚合酶有核定位訊號（NLS），經核糖體翻譯出來後會經核孔複合體（NPC）介導下入核，因此在有絲分裂間期不會長期存在轉錄相關酶。但是M期核膜崩解了就不一定了，沒有核膜的約束，基質裡肯定會存在大量RNA聚合酶。核膜消失後減數第一次分裂前期的雙線期同樣存在DNA大量轉錄，同時會形成特殊的袢環結構。不過分裂末期核膜再次形成時核孔複合體會逐個把細胞核蛋白回收，因為核定位訊號在蛋白質內部，加工後不被切去且非常穩定。第二，有義鏈與模板鏈只是相對而言。轉錄時，一次只轉錄一條鏈（即不對稱轉錄），轉錄哪條只和DNA上的順式作用元件有關，簡單理解就是，啟動子的強弱決定轉錄的頻率。而啟動子的強弱與該啟動子與啟動子一致序列的相似度直接相關。第三個問題問了什麼，反正我沒看懂。原核生物轉錄的終止有兩種機制:1、非pho因子依賴型/簡單終止在終止區出現富含GC的迴文序列，迴文序列下游有多聚U序列。富含GC的迴文序列可以自主形成莖環結構（鏈內配對），可以停頓RNA聚合酶的移動與促進轉錄泡的坍縮，多聚U可形成的氫鍵較弱，可以鬆弛RNA聚合酶與模板鏈的結合促進解聚。2、pho因子依賴型這種模式為噬菌體常用。這種情況下轉錄物的5"端存在pho因子利用位點（nut），pho因子可以結合到轉錄物的5"端，利用自身ATPase活性向3"端移動，當其追上暫停於終止區的聚合酶時，其利用自身解鏈酶活性解開雜交雙鏈，釋放出hnRNA和RNA聚合酶。真核生物的轉錄終止:更接近簡單終止型，不同之處是沒有莖環結構的形成。注意真核生物有可變加尾的特徵，終止區通常有加尾訊號。以上，題主的分子生物學還需努力。所有資料來自《生物化學原理》第二版，作者是本人偶像楊榮武教授。想看故事版的DNA轉錄歡迎移步我的另一個回答。（不會貼連結，請知乎搜尋“孤獨的聚合酶”）這麼幹貨的回答留個讚唄~