無公害農產品、綠色食品、有機食品區別為：性質不同、質量標準不同、生產不同。無公害農產品、綠色食品、有機食品都是健康安全的食品。

一、性質不同

1、無公害農產品：無公害農產品是指產地環境、生產過程、產品質量符合國家有關標準和規範的要求，經認證合格獲得認證證書並允許使用無公害農產品標誌的未經加工或初加工的食用農產品。

2、綠色食品：綠色食品是指遵循可持續發展原則，按照特定生產方式生產，經專門機構認定，許可使用綠色食品標誌商標的無汙染的安全、優質、營養類食品。

3、有機食品：有機食品是指來自有機農業生產體系，根據有機農業生產要求和相應標準生產加工，並且透過合法的、獨立的有機食品認證機構認證的農副產品及其加工品。

二、質量標準不同

1、無公害農產品：無公害農產品質量標準參照國內普通食品衛生標準。

2、綠色食品：綠色食品質量標準參照聯合國糧農組織和世界衛生組織標準。

3、有機食品：有機食品質量標準參照歐盟和國際有機運動聯盟(1POAM)的有機農業和產品加工基本標準。

三、生產不同

1、無公害農產品：無公害農產品生產必須在良好的生態環境下，遵守無公害農產品技術規程，可以科學、合理地使用化學合成物。

2、綠色食品：綠色食品生產是將傳統農業技術與現代常規農業技術相結合。

3、有機食品：有機食品生產必須採用有機生產方式，絕對禁止使用農藥，化學色素和防腐劑等化學物質，不使用基因工程技術。