電子商務系統主要有以下六個方面組成：

1、電子商務系統基礎層 電子商務系統基礎層是電子商務系統的執行環境，包括計算機軟體、硬體和網路平臺。

2、電子商務系統服務層 電子商務系統服務層直接為應用系統提供服務，最佳化應用功能，是應用層的必要補充。 這一層實現了標準的網上商務活動、系統最佳化、系統管理、系統/應用整合服務，如建立標準的商品目錄/價目表、開發電子支付工具、保證商業資訊保安傳送、認證買賣雙方的合法性、控制流量等。

3、 電子商務系統應用層 應用層所對應的應用系統是電子商務系統的核心部分，是開發過程中需要編寫的主要的。 它實現系統的核心商務邏輯，如企業宣傳、網上銀行、網上購物、虛擬電子市場、拍賣等具體應用模組。電子商務應用系統主要包括電子商務網站、資料庫系 統、支付系統、安全系統等。

4、電子商務系統社會環境層 社會環境層包含了關於電子商務的公共政策、法律法規、安全問題以及技術標準規範等。

5、電子商務系統表達層與客戶端 表達層的作用是為應用層提供客戶端表達支援，將商務應用層的各種邏輯處理結果以不同的形式提交給客戶端，並負責完成電子商務系統與其服務客戶之間的互動。客戶端是客戶接受電子商務系統服務的終點，它可以是個人計算機、手機等終端裝置。

6、內部系統介面與外部系統介面 內部系統是指企業內部資訊系統，負責企業內部的生產及管理，包括企業ERP系統、CRM系統、HRM系統、內部資料庫系 統等資訊資源。 外部系統主要是指與電子商務系統發生資料交換的企業外的其他資訊系統，包括銀行支付閘道器、認證中心、配送機構以及其他企業的資訊系統。