1.硝化菌並不能分解魚排洩物2.硝化菌並不能分解水中的硫化氫(H2S),反而會被水中的硫化氫毒害死亡3.硝化菌是沒有味道的,就算死後也只會有微弱的臭味4.硝化菌無法將氨(NH3)直接氧化為硝酸鹽(NO3)5.硝化菌只是一個統稱,其中主要有亞硝酸菌和硝酸菌；亞硝酸菌能將氨(NH3)氧化為亞硝酸鹽(NO2)，而硝酸菌能將亞硝酸鹽氧化為硝酸鹽(NO3)6.硝化菌要先將氨(NH3)氧化為亞硝酸鹽(NO2)，然後再將為亞硝酸鹽(NO2)氧化為硝酸鹽(NO3)7.硝化菌的生長需要氧氣8.二氧化碳不但對硝化菌無害，而且硝化菌需要靠二氧化碳來繁殖和生存9.硝化菌是無所不在的10.硝化菌在魚缸的生長是緩慢的，靠自生方式來建構硝化系統的話，通常需要一個月或以上11.硝化菌並不需光照生長，反而有避光生長的現象12.硝化菌並不能改善水質白濁的問題，而且一丁點的關係都沒有13.硝化菌非常難儲存，市面所賣的硝化菌絕大多數都是魚目混珠的，大家選購的時候還是儘量選購大品牌的14.硝化菌在裸缸中所發揮的作用比草缸大，因為大部份水草能代替硝化菌的作用加硝化菌的原因是什麼？是硝化菌不足一般只有1.開缸時2.或硝化系統有問題時3.突然魚多或魚密度超過了過濾系統能力時開缸時，特別是複合多菌開缸時，用量一多會混水，多次少量加，是可以的。

硝化有問題時，如是純硝化菌還好，如是一些市場上的名為“硝化菌”實為“硝化菌營養劑，或+淨水劑”，只有加劇水質的惡化。

突然魚多，或魚密度超過了過濾系統能力時，就要看是否超過了魚缸過濾力量的最大能力。

如超過了，只有減魚或換缸、加大過濾能力。

當然足量的生化濾材和適合的濾槽、或其它適合的生存環境也是一個主要問題。

因為只要有合適的環境，硝化菌是可以自然生成的。

如果你的硝化系統的硬體是不足的。

不斷的加硝化菌，多的硝化菌還是沒有合適的地方生活，你加了也只是暫時淨化水質，沒有解決根本問題，同時影響水質穩定性。

如果你的硝化系統是足夠的，多加的對水質和你的錢包又有什麼好處呢？