違反《傳染病防治法》，因不同的主體有不同的處罰方式，分別是：
第六十五條 地方各級人民政府未依照本法的規定履行報告職責，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情，或者在傳染病暴發、流行時，未及時組織救治、採取控制措施的，由上級人民政府責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員，依法給予行政處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第六十六條 縣級以上人民政府衛生行政部門違反本法規定，有下列情形之一的，由本級人民政府、上級人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予行政處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）未依法履行傳染病疫情通報、報告或者公佈職責，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情的；
（二）發生或者可能發生傳染病傳播時未及時採取預防、控制措施的；
（三）未依法履行監督檢查職責，或者發現違法行為不及時查處的；
（四）未及時調查、處理單位和個人對下級衛生行政部門不履行傳染病防治職責的舉報的；
（五）違反本法的其他失職、瀆職行為。
第六十七條 縣級以上人民政府有關部門未依照本法的規定履行傳染病防治和保障職責的，由本級人民政府或者上級人民政府有關部門責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予行政處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第六十八條 疾病預防控制機構違反本法規定，有下列情形之一的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令限期改正，通報批評，給予警告；對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷有關責任人員的執業證書；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）未依法履行傳染病監測職責的；
（二）未依法履行傳染病疫情報告、通報職責，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情的；
（三）未主動收集傳染病疫情資訊，或者對傳染病疫情資訊和疫情報告未及時進行分析、調查、核實的；
（四）發現傳染病疫情時，未依據職責及時採取本法規定的措施的；
（五）故意洩露傳染病病人、病原攜帶者、疑似傳染病病人、密切接觸者涉及個人隱私的有關資訊、資料的。
第六十九條 醫療機構違反本法規定，有下列情形之一的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評，給予警告；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷有關責任人員的執業證書；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）未按照規定承擔本單位的傳染病預防、控制工作、醫院感染控制任務和責任區域內的傳染病預防工作的；
（二）未按照規定報告傳染病疫情，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情的；
（三）發現傳染病疫情時，未按照規定對傳染病病人、疑似傳染病病人提供醫療救護、現場救援、接診、轉診的，或者拒絕接受轉診的；
（四）未按照規定對本單位內被傳染病病原體汙染的場所、物品以及醫療廢物實施消毒或者無害化處置的；
（五）未按照規定對醫療器械進行消毒，或者對按照規定一次使用的醫療器具未予銷燬，再次使用的；
（六）在醫療救治過程中未按照規定保管醫學記錄資料的；
（七）故意洩露傳染病病人、病原攜帶者、疑似傳染病病人、密切接觸者涉及個人隱私的有關資訊、資料的。
第七十條 採供血機構未按照規定報告傳染病疫情，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情，或者未執行國家有關規定，導致因輸入血液引起經血液傳播疾病發生的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評，給予警告；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷採供血機構的執業許可證；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
非法採集血液或者組織他人出賣血液的，由縣級以上人民政府衛生行政部門予以取締，沒收違法所得，可以並處十萬元以下的罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第七十一條 國境衛生檢疫機關、動物防疫機構未依法履行傳染病疫情通報職責的，由有關部門在各自職責範圍內責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第七十二條 鐵路、交通、民用航空經營單位未依照本法的規定優先運送處理傳染病疫情的人員以及防治傳染病的藥品和醫療器械的，由有關部門責令限期改正，給予警告；造成嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分。
第七十三條 違反本法規定，有下列情形之一，導致或者可能導致傳染病傳播、流行的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令限期改正，沒收違法所得，可以並處五萬元以下的罰款；已取得許可證的，原發證部門可以依法暫扣或者吊銷許可證；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）飲用水供水單位供應的飲用水不符合國家衛生標準和衛生規範的；
（二）涉及飲用水衛生安全的產品不符合國家衛生標準和衛生規範的；
（三）用於傳染病防治的消毒產品不符合國家衛生標準和衛生規範的；
（四）出售、運輸疫區中被傳染病病原體汙染或者可能被傳染病病原體汙染的物品，未進行消毒處理的；
（五）生物製品生產單位生產的血液製品不符合國家質量標準的。
第七十四條 違反本法規定，有下列情形之一的，由縣級以上地方人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評，給予警告，已取得許可證的，可以依法暫扣或者吊銷許可證；造成傳染病傳播、流行以及其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷有關責任人員的執業證書；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）疾病預防控制機構、醫療機構和從事病原微生物實驗的單位，不符合國家規定的條件和技術標準，對傳染病病原體樣本未按照規定進行嚴格管理，造成實驗室感染和病原微生物擴散的；
（二）違反國家有關規定，採集、保藏、攜帶、運輸和使用傳染病菌種、毒種和傳染病檢測樣本的；
（三）疾病預防控制機構、醫療機構未執行國家有關規定，導致因輸入血液、使用血液製品引起經血液傳播疾病發生的。
違反《傳染病防治法》，因不同的主體有不同的處罰方式，分別是：
第六十五條 地方各級人民政府未依照本法的規定履行報告職責，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情，或者在傳染病暴發、流行時，未及時組織救治、採取控制措施的，由上級人民政府責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員，依法給予行政處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第六十六條 縣級以上人民政府衛生行政部門違反本法規定，有下列情形之一的，由本級人民政府、上級人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予行政處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）未依法履行傳染病疫情通報、報告或者公佈職責，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情的；
（二）發生或者可能發生傳染病傳播時未及時採取預防、控制措施的；
（三）未依法履行監督檢查職責，或者發現違法行為不及時查處的；
（四）未及時調查、處理單位和個人對下級衛生行政部門不履行傳染病防治職責的舉報的；
（五）違反本法的其他失職、瀆職行為。
第六十七條 縣級以上人民政府有關部門未依照本法的規定履行傳染病防治和保障職責的，由本級人民政府或者上級人民政府有關部門責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予行政處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第六十八條 疾病預防控制機構違反本法規定，有下列情形之一的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令限期改正，通報批評，給予警告；對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷有關責任人員的執業證書；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）未依法履行傳染病監測職責的；
（二）未依法履行傳染病疫情報告、通報職責，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情的；
（三）未主動收集傳染病疫情資訊，或者對傳染病疫情資訊和疫情報告未及時進行分析、調查、核實的；
（四）發現傳染病疫情時，未依據職責及時採取本法規定的措施的；
（五）故意洩露傳染病病人、病原攜帶者、疑似傳染病病人、密切接觸者涉及個人隱私的有關資訊、資料的。
第六十九條 醫療機構違反本法規定，有下列情形之一的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評，給予警告；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷有關責任人員的執業證書；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）未按照規定承擔本單位的傳染病預防、控制工作、醫院感染控制任務和責任區域內的傳染病預防工作的；
（二）未按照規定報告傳染病疫情，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情的；
（三）發現傳染病疫情時，未按照規定對傳染病病人、疑似傳染病病人提供醫療救護、現場救援、接診、轉診的，或者拒絕接受轉診的；
（四）未按照規定對本單位內被傳染病病原體汙染的場所、物品以及醫療廢物實施消毒或者無害化處置的；
（五）未按照規定對醫療器械進行消毒，或者對按照規定一次使用的醫療器具未予銷燬，再次使用的；
（六）在醫療救治過程中未按照規定保管醫學記錄資料的；
（七）故意洩露傳染病病人、病原攜帶者、疑似傳染病病人、密切接觸者涉及個人隱私的有關資訊、資料的。
第七十條 採供血機構未按照規定報告傳染病疫情，或者隱瞞、謊報、緩報傳染病疫情，或者未執行國家有關規定，導致因輸入血液引起經血液傳播疾病發生的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評，給予警告；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷採供血機構的執業許可證；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
非法採集血液或者組織他人出賣血液的，由縣級以上人民政府衛生行政部門予以取締，沒收違法所得，可以並處十萬元以下的罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第七十一條 國境衛生檢疫機關、動物防疫機構未依法履行傳染病疫情通報職責的，由有關部門在各自職責範圍內責令改正，通報批評；造成傳染病傳播、流行或者其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第七十二條 鐵路、交通、民用航空經營單位未依照本法的規定優先運送處理傳染病疫情的人員以及防治傳染病的藥品和醫療器械的，由有關部門責令限期改正，給予警告；造成嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分。
第七十三條 違反本法規定，有下列情形之一，導致或者可能導致傳染病傳播、流行的，由縣級以上人民政府衛生行政部門責令限期改正，沒收違法所得，可以並處五萬元以下的罰款；已取得許可證的，原發證部門可以依法暫扣或者吊銷許可證；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）飲用水供水單位供應的飲用水不符合國家衛生標準和衛生規範的；
（二）涉及飲用水衛生安全的產品不符合國家衛生標準和衛生規範的；
（三）用於傳染病防治的消毒產品不符合國家衛生標準和衛生規範的；
（四）出售、運輸疫區中被傳染病病原體汙染或者可能被傳染病病原體汙染的物品，未進行消毒處理的；
（五）生物製品生產單位生產的血液製品不符合國家質量標準的。
第七十四條 違反本法規定，有下列情形之一的，由縣級以上地方人民政府衛生行政部門責令改正，通報批評，給予警告，已取得許可證的，可以依法暫扣或者吊銷許可證；造成傳染病傳播、流行以及其他嚴重後果的，對負有責任的主管人員和其他直接責任人員，依法給予降級、撤職、開除的處分，並可以依法吊銷有關責任人員的執業證書；構成犯罪的，依法追究刑事責任：
（一）疾病預防控制機構、醫療機構和從事病原微生物實驗的單位，不符合國家規定的條件和技術標準，對傳染病病原體樣本未按照規定進行嚴格管理，造成實驗室感染和病原微生物擴散的；
（二）違反國家有關規定，採集、保藏、攜帶、運輸和使用傳染病菌種、毒種和傳染病檢測樣本的；
（三）疾病預防控制機構、醫療機構未執行國家有關規定，導致因輸入血液、使用血液製品引起經血液傳播疾病發生的。