貝類的身體柔軟，左右對稱，不分節，由頭、斧足、內臟囊、外套膜和貝殼5部分組成。頭部生有口、眼和觸角等感覺器官。斧足在身體的腹面，由強健的肌肉組成，是爬行、挖掘泥沙或游泳的器官。內臟囊位於身體背部，包括心臟、腎臟、胃、腸、消化腺和生殖腺等內臟器官。外套膜包被於身體的外面，系由內外兩層表皮和其間的結締組織、少許肌肉組成。外套膜的表皮細胞分泌貝殼，外套膜和貝殼都是貝類的保護器官。
貝類的神經系統由腦、足、側、髒 4對神經節和與其聯絡的神經構成。腦神經節位於食道的背側，派出神經至頭部和體前部；足神經節位於足的前部，派出神經至足部；側神經節位於身體前部，派出神經至外套和鰓；髒神經節位於身體之後部，派出神經至內臟諸器官。貝類原始的種類神經系統簡單，沒有顯著的神經節，較進化的種類形成神經節，更進化的種類則是各神經節集中在頭部形成“腦”。感覺器官主要有觸角、眼、平衡囊、嗅檢器等。
消化系統包括口、齒舌食道、胃腸、肛門和附屬的消化腺，其中齒舌是貝類比較特殊的舐食和磨碎食物的器官，又是分類的重要根據之一。
貝類靠鰓和肺呼吸。水生的種類有鰓，通常由外套膜內麵皮膚伸展形成的，稱為本鰓。每一鰓片鰓軸的兩側或一側生有鰓絲，鰓上生有纖毛。依纖毛的運動使呼吸水流按一定線路透過鰓進行氣體交換。有的種類本鰓消失，而用面板表面或在面板表面形成二次性鰓（後鰓類）進行呼吸。陸生種類外套膜的一部分形成脈網密集的肺室，藉以在空氣中呼吸。
迴圈系統一般是開管式的，但在高等的頭足類動脈管和靜脈管由微血管聯絡成為閉管式。貝類迴圈系的中樞為心臟，心臟有1個心室，1個、2個或4個心耳。血液含血青素，一般無色，僅少數種類如雙殼類的蚶和腹足類的扁卷螺有血紅素，血液為紅色。
排洩系統的主要器官為腎臟。腎由具纖毛的腎管形成，一端與圍心腔相通，另一端在外套腔中開口。腎臟的數目因種類而異，有6對、2對、1對或僅1個的。除腎臟外，有的種類圍繞心腔壁上的腺體或肝臟的一部分也有排洩功能。
生殖系統包括生殖腺、生殖輸送管、交接器和一些附屬腺體。雌雄異體或雌雄同體。
貝類的身體柔軟，左右對稱，不分節，由頭、斧足、內臟囊、外套膜和貝殼5部分組成。頭部生有口、眼和觸角等感覺器官。斧足在身體的腹面，由強健的肌肉組成，是爬行、挖掘泥沙或游泳的器官。內臟囊位於身體背部，包括心臟、腎臟、胃、腸、消化腺和生殖腺等內臟器官。外套膜包被於身體的外面，系由內外兩層表皮和其間的結締組織、少許肌肉組成。外套膜的表皮細胞分泌貝殼，外套膜和貝殼都是貝類的保護器官。
貝類的神經系統由腦、足、側、髒 4對神經節和與其聯絡的神經構成。腦神經節位於食道的背側，派出神經至頭部和體前部；足神經節位於足的前部，派出神經至足部；側神經節位於身體前部，派出神經至外套和鰓；髒神經節位於身體之後部，派出神經至內臟諸器官。貝類原始的種類神經系統簡單，沒有顯著的神經節，較進化的種類形成神經節，更進化的種類則是各神經節集中在頭部形成“腦”。感覺器官主要有觸角、眼、平衡囊、嗅檢器等。
消化系統包括口、齒舌食道、胃腸、肛門和附屬的消化腺，其中齒舌是貝類比較特殊的舐食和磨碎食物的器官，又是分類的重要根據之一。
貝類靠鰓和肺呼吸。水生的種類有鰓，通常由外套膜內麵皮膚伸展形成的，稱為本鰓。每一鰓片鰓軸的兩側或一側生有鰓絲，鰓上生有纖毛。依纖毛的運動使呼吸水流按一定線路透過鰓進行氣體交換。有的種類本鰓消失，而用面板表面或在面板表面形成二次性鰓（後鰓類）進行呼吸。陸生種類外套膜的一部分形成脈網密集的肺室，藉以在空氣中呼吸。
迴圈系統一般是開管式的，但在高等的頭足類動脈管和靜脈管由微血管聯絡成為閉管式。貝類迴圈系的中樞為心臟，心臟有1個心室，1個、2個或4個心耳。血液含血青素，一般無色，僅少數種類如雙殼類的蚶和腹足類的扁卷螺有血紅素，血液為紅色。
排洩系統的主要器官為腎臟。腎由具纖毛的腎管形成，一端與圍心腔相通，另一端在外套腔中開口。腎臟的數目因種類而異，有6對、2對、1對或僅1個的。除腎臟外，有的種類圍繞心腔壁上的腺體或肝臟的一部分也有排洩功能。
生殖系統包括生殖腺、生殖輸送管、交接器和一些附屬腺體。雌雄異體或雌雄同體。