直言受宮刑　　天漢二年(公元前99年)，正當司馬遷全身心地撰寫《史記》之時，卻遇上了飛來橫禍，這就是李陵事件。　　這年夏天，武帝派自己寵妃李夫人的哥哥、二師將軍李廣利領兵討伐匈奴，另派李廣的孫子、別將李陵隨從李廣利押運輜重。李廣帶領步卒五千人出居延，孤軍深入浚稽山，與單于遭遇。匈奴以八萬騎兵圍攻李陵。經過八晝夜的戰鬥，李陵斬殺了一萬多匈奴，但由於他得不到主力部隊的後援，結果彈盡糧絕，不幸被俘。 李陵兵敗的訊息傳到長安後，武帝本希望他能戰死，後聽說他卻投了降，憤怒萬分，滿朝文武官員察言觀色，趨炎附勢，幾天前還紛紛稱讚李陵的英勇，現在卻附和漢武帝，指責李陵的罪過。漢武帝詢問太史令司馬遷的看法，司馬遷一方面安慰武帝，一方面也痛恨那些見風使舵的大臣，盡力為李陵辯護。他認為李陵平時孝順母親，對朋友講信義，對人謙虛禮讓，對士兵有恩信，常常奮不顧身地急國家之所急，有國士的鳳範。司馬遷痛恨那些只知道保全自己和家人的大臣，他們如今見李陵出兵不利，就一味地落井下石，誇大其罪名。他對漢武帝說:"李陵只率領五千步兵，深入匈奴，孤軍奮戰，殺傷了許多敵人，立下了赫赫功勞。在救兵不至、彈盡糧絕、走投無路的情況下，仍然奮勇殺敵。就是古代名將也不過如此。李陵自己雖陷於失敗之中，而他殺傷匈奴之多，也足以顯赫於天下了。他之所以不死，而是投降了匈奴，一定是想尋找適當的機會再報答漢室。"

漢武帝天漢二年（前99年），武帝想讓李陵為出酒泉擊匈奴右賢王的貳師將軍李廣利護送輜重。李陵謝絕，並自請步兵五千涉單于庭以寡擊眾，武帝讚賞李陵的勇氣並答應了他。然而，李陵行至浚稽山時卻遭遇匈奴單于之兵，路博德援兵不到，匈奴之兵卻越聚越多，糧盡矢絕之後，李陵最終降敵。漢武帝為此大怒，牆頭草般的群臣也來不及繼續恭維李陵，轉而紛紛進言對李陵表示不恥。

漢武帝問想聽太史令司馬遷的意見，司馬遷卻耿直地說，李陵向來是個勤謹奉上，寬仁待下，忠君愛國的好將士，怎麼可能說投降就投降，他可能心裡還想著，哪日能夠迴歸朝廷，再為國盡忠。司馬遷說的違逆了漢武帝的意思，於是漢武帝就把司馬遷打入了鐵牢。

後來，漢武帝派公孫敖去匈奴接李陵，公孫敖無功而返，怕漢武帝怪罪，公孫敖誣告李陵正在匈奴練兵，要奉單于之命進攻長安。

漢武帝信以為真，盛怒之下下令殺死了李陵一家妻兒老小，為李陵說話的司馬遷也因此受到了牽連，按律當斬。但是漢朝當時可以以宮刑代替死刑，司馬遷心中還有宏偉的理想，背上還有祖輩們的遺願，因此司馬遷選擇了接受宮刑，保住了性命。