中書省和行中書省的區別有開始實行的朝代不同、管轄範圍不同、職責不同，雖然兩者的名字只是想差一個字，但是中書省是官署名，行中書省是行政區劃分。行中書省掌管轄境內的錢糧、兵甲、屯種、漕運及其他軍國重事，統領路、府、州、縣，距離省治遠的地方，另設宣慰司統之，作為行省的派出機構，而中書省總理全國政務，領轄六部，職權甚重。

中書省是皇帝直屬的中書官署，為秉承君主意旨，掌管機要、釋出皇帝詔書、中央政令的最高機構。而行中書省則是直屬中央政府管轄的一級行政區，當時主要作為軍事管理，掌管所轄省內的錢糧、兵甲、屯種、漕運及其他軍政事務。

中書省是古代官署名。封建政權執政中樞部門，漢朝始設中書令，魏國建秘書監，有監、令，魏曹丕改稱中書監、令。晉朝以後稱中書省，為秉承君主意旨，掌管機要、釋出政令的機構。沿至隋唐，遂成為全國政務中樞。宋元時中書版省設中書令和中書丞相，明清時期廢置。

行中書省是元行政區劃名，民間簡稱“行省”或“省”。元置中書省總理全國政務，也稱都省；因幅員遼闊，除腹裡地區（今河北、山東、山西及河南，內蒙古部分地區）直隸於中書省、吐蕃權地區由宣政院管轄外，又於諸路重要都會設立十個行中書省，以分管各地區。在世祖、武宗朝三次短期設立尚書省主管政務期間，行中書省也相應改稱行尚書省。