一、培養方向不同

衛生檢驗與檢疫專業培養具有預防醫學、衛生理化檢驗及微生物學檢驗等方面的基本知識和操作技能的高階技術應用性專門人才。培養適應中國社會主義現代化建設需要的德、智、體、美全面發展，具有正確的世界觀、人生觀和價值觀。

醫學檢驗專業培養具有基礎醫學、臨床醫學、醫學檢驗等方面的基本理論知識和基本能力，能在各級醫院、血站及防疫等部門從事醫學檢驗及醫學類實驗室工作的醫學高階專門人才。學生應掌握基礎醫學、臨床醫學、醫學檢驗、實驗診斷等方面的基本理論知識和實驗操作能力。

二、核心課程不同

衛生檢驗與檢疫專業核心課程有英語、計算機、分析化學、儀器分析、臨床檢驗學基礎、免疫學與臨床免疫檢驗、寄生蟲學及檢驗、空氣理化檢驗學、水質理化檢驗學、食品理化檢驗學、生物材料理化檢驗、衛生檢驗檢疫、微生物學及檢驗、病毒學及檢驗、細菌學及檢驗必修課程。

醫學檢驗專業有機化學、無機化學、物理化學、生物化學、分子生物學、醫學統計學、分析化學、檢驗儀器學、生理學、病理學、系統解剖學、區域性解剖學、寄生蟲學及檢驗、微生物學及檢驗、免疫學及檢驗、血液學檢驗、臨床生物化學及檢驗、臨床輸血與檢驗、臨床基礎檢驗等。

三、就業前景不同

衛生檢驗與檢疫專業畢業生一般在疾病預防控制中心、醫院的檢驗科室、出入境檢驗檢疫局、食品藥品監督、農產品質量監督、衛生與計劃生育委員會、海關、食品公司、藥品公司、化妝品公司、自來水廠，環保局、質監局、醫療器械的銷售、第三方檢驗檢測測公司及部分監獄等就業。

醫學檢驗是對取自人體的材料進行微生物學、免疫學、生物化學、遺傳學、血液學、生物物理學、細胞學等方面的檢驗，從而為預防、診斷、治療人體疾病和評估人體健康提供資訊的一門科學。畢業後能夠從事臨床各科醫學檢驗、醫學檢驗教學與科研工作。