單子葉植物根莖　　一般均具初生構造。外表通常為一列表皮細胞，少數根莖皮層外部細胞木栓化，形成後生皮層，代替表皮起保護作用，如藜蘆等。皮層明顯，常有葉跡維管束散在；內皮層通常可見，較粗大的根莖則不明顯。中柱中有多數維管束散佈。髓部不明顯。維管束大多為有限外韌型，也有周木型。　　雙子葉的根莖　　一般均具次生構造，與地上莖相似。外表常有木栓層，少數有表皮。如木栓形成層發生在皮層外方，則初生皮層仍然存在，如黃連等；有些根莖僅有栓內層細胞構成次生皮層。皮層中有根跡維管束或葉跡維管束斜向透過，內皮層多不明顯。中柱外方部位有的具厚壁組織，如纖維和石細胞群，常排成不連續的環。草本植物的根莖維管束大多為無限外韌型，少數為雙韌型，多呈環狀排列，束間被髓射線分隔。中央有髓部。雙子葉植物根莖除上述正常構造外，還可形成異常構造，常見的有下列二種型別：　　① 髓部有異常維管束，其韌皮部和木質部的位置常與外部正常維管束倒置，即韌皮部在內側，木質部在外方，如大黃等。　　② 具內生韌皮部（Internal Phloem），就是位於木質部裡端的韌皮部。有的與木質部裡端密切接觸，構成正常的雙韌型維管束；有的在髓部的周圍形成各個分離的韌皮部束。 內生韌皮部存在的位置和形成均與內函韌皮部不同，如茄科、葫蘆科植物等。