第一，將現在香港特區政府主要官員，包括政務司長、財政司長、律政司長以及所有政策局局長，全部列入問責制範圍。這些官員將不再是公務員，而是以合約形式聘用的主要官員，任期５年，但不超過將其提名的行政長官任期。在任期內，這些主要官員各自負責行政長官指定的政策範疇，統領所轄部門工作，制定政策，解釋政策，為政策作推介，爭取政策為立法會、市民所支援，併為政策的成敗直接向行政長官負責，透過行政長官的領導，履行對市民的責任。行政長官認為需要的時候，可以終止與其簽定的合約。

第二，將特區政府現有政策局進行合併。合併之後，原16個政策局將減為11個，加上3個司，實行問責制的主要官員職位共14個，分別為：政務司司長、財政司司長、律政司司長、民政事務局局長、政制事務局局長、房屋及規劃地政局局長、教育局局長、環境衛生福利局局長、運輸及工務局局長、經濟發展局局長、工商及人力資源局局長、財經事務及庫務局局長、保安局局長、公務員事務局局長。這一變化也將帶來行政會議的變革，所有列入問責制範圍的主要官員將全部進入行政會議，以強化行政會議的工作，直接參與制定政府的整體決策，決定政策推行的優先順序，協調跨部門的工作事項。

第三，現在公務員體系中由局長擔任的公務員職級及薪酬、福利待遇保持不變，他們將改稱為常任秘書長，扮演問責制局長與公務員之間的樞紐角色，在問責制局長的統領下，向局長負責，協助制定、執行政策，聽取公眾和立法會意見，爭取各界對政策的支援。