繁殖牡丹最簡便的方法是分株。可於秋分寒露間進行，若生長期進行分株，則會生長不良，甚至會造成死亡。寒冬及春季株也容易死亡。 菏澤多禾牡丹專業種植基地技術人員提醒：分株時，先將植株(全株)掘起。因牡丹根較深，挖時要離根些，挖得深些。去除敗枝朽根，用利刀順其自然從根上劈下(或手扒也可以)，注意不使根芽損傷，每一分株保留適量的根系及頸處的櫱芽。牡丹根系肥大，容易折斷，掘起後陰乾1―2天再劈。若主幹是獨幹或幹很少，無株可分，可在春天培土高10釐米，並保持溼潤，待基部長出新枝新根，第二年秋天再進行分株，這樣對母株便無影響。 分株後傷口處最好用硫酸銅或高錳酸鉀溶液塗抹消毒，以感染病害。選擇好合適的栽培地點(地勢稍高，排水良好，陰涼、肥沃處)挖好坑後，噴灑一些敵敵畏等藥劑防止害蟲傷根。栽植時根理直，不可扭曲。栽好覆士並踩實，連續澆幾次水，使土壤完全沉實，與根接觸密實。華北地區天寒，第一年要保護越冬，用3層舊報紙將植株包裹即可。裹前要先用草繩將枝條捆攏，捆前用一剪把葉子剪去，保留一部分葉柄的保護芽不致碰壞。第二年3月中、下旬再開啟。

在7～8月將4～5年生的植株挖出，去掉附土，順其自然生長紋理從根頸處將其分成若干株，每株都要有部分細根，並至少保留2～3個芽。

分株後的小苗要將根頸上部的老枝剪除，而從根頸處萌生的當年新枝不要剪除。晾1～2天促進傷口癒合，根部蘸草木灰，或栽植前用高錳酸鉀或硫酸銅等藥液塗抹傷口。也可不挖母株，只將四周的小株挖出另栽。