目前應用最廣泛的是由FrederickSanger發明的Sanger雙脫氧鏈終止法（ChainTerminationMethod）。新的測序方法，例如454生物科學的方法和焦磷酸測序法。
Sanger（桑格）雙脫氧鏈終止法是Sanger於1975年發明的。測序過程需要先做一個PCR反應。PCR過程中，雙脫氧核糖核酸可能隨機的被加入到正在合成中的DNA片段裡。由於雙脫氧核糖核酸多脫了一個氧原子，一旦它被加入到DNA鏈上，這個DNA鏈就不能繼續增加長度。最終的結果是獲得所有可能獲得的、不同長度的DNA片段。目前最普遍最先進的方法，是將雙脫氧核糖核酸進行不同熒游標記。將PCR反應獲得的總DNA透過毛細管電泳分離，跑到最末端的DNA就可以在鐳射的作用下發出熒光。由於ddATP,ddGTP,ddCTP,ddTTP（4種雙脫氧核糖核酸）熒游標記不同，計算機可以自動根據顏色判斷該位置上鹼基究竟是A，T，G，C中的哪一個。
454測序法由454生物科學發明，是一個類似焦磷酸測序法的新方法。2003年向GenBank提交了一個腺病毒全序列，使得他們的技術成為Sanger測序法後第一個被用來測生物基因組全序列的新方法。454使用類似於焦磷酸測序的方法，有著相當高的讀取速度，大約為5小時可以測兩千萬鹼基對
目前應用最廣泛的是由FrederickSanger發明的Sanger雙脫氧鏈終止法（ChainTerminationMethod）。新的測序方法，例如454生物科學的方法和焦磷酸測序法。
Sanger（桑格）雙脫氧鏈終止法是Sanger於1975年發明的。測序過程需要先做一個PCR反應。PCR過程中，雙脫氧核糖核酸可能隨機的被加入到正在合成中的DNA片段裡。由於雙脫氧核糖核酸多脫了一個氧原子，一旦它被加入到DNA鏈上，這個DNA鏈就不能繼續增加長度。最終的結果是獲得所有可能獲得的、不同長度的DNA片段。目前最普遍最先進的方法，是將雙脫氧核糖核酸進行不同熒游標記。將PCR反應獲得的總DNA透過毛細管電泳分離，跑到最末端的DNA就可以在鐳射的作用下發出熒光。由於ddATP,ddGTP,ddCTP,ddTTP（4種雙脫氧核糖核酸）熒游標記不同，計算機可以自動根據顏色判斷該位置上鹼基究竟是A，T，G，C中的哪一個。
454生物科學和焦磷酸測序法454測序法由454生物科學發明，是一個類似焦磷酸測序法的新方法。2003年向GenBank提交了一個腺病毒全序列，使得他們的技術成為Sanger測序法後第一個被用來測生物基因組全序列的新方法。454使用類似於焦磷酸測序的方法，有著相當高的讀取速度，大約為5小時可以測兩千萬鹼基對