1、宗人府
掌管明朝皇帝九族的宗族名冊，並按時撰寫帝王譜系，記錄宗室成員子女的嫡庶、名稱封號、嗣職襲位、生卒年間、婚嫁、喪葬諡號等事。凡是宗室陳述請求，均為之向皇上彙報，並引薦賢才、記錄得失等。明朝洪武三年，設立大宗正院。
洪武二十二年，改名宗人府，並命親王掌管，秦王朱樉為第一任宗人令。此後，均以元勳外戚大臣兼領，不再專設官員，其負責事務轉移至禮部。
2、三公
三公，即明朝的太師、太傅、太保三職的合稱，正一品。負責協助皇帝處理重要國事政務，職位至重。洪武三年，明太祖朱元璋授李善長為太師、徐達為太傅、常遇春為太保。建文年間，三公職位被撤。直到永樂二十年八月，明成祖朱棣再恢復三公職位，但無實授。
宣德三年，明宣宗授英國公張輔為太師，沐晟為太傅，陳懋為太保，當時三公官職，幾乎為專授。自宣德、正統年間以後，三公成為虛銜，為勳戚文武大臣加官、贈官。
3、中書省
明朝中書省，為明朝初期至洪武十三年（1380年）期間的行政中樞。其中丞相為明朝中書省的最高階長官，負責統領六部。明初沿襲元朝制度，設立中書省，置左、右丞相。甲辰正月，初置左、右相國，其中李善長為右相國，徐達為左相國。
吳元年，改右相國為左相國，左相國為右相國。洪武元年，改為左、右丞相。由中書省統六部，但不設定中書令。洪武十三年（1380年），胡惟庸案之後，明太祖朱元璋罷中書省，分中書省之權歸於六部。原中書省官屬盡革，惟存中書舍人。
4、明朝內閣
明朝內閣，為明成祖首先確立。乃是明朝建文四年（1402年）至崇禎十七年（1644年）的皇帝諮政機構，此後權力逐漸增大，後形成為明朝行政中樞。內閣輔臣的人數為一人至七人不等，輔臣奉使出外辦事，多自稱閣部。明太祖廢除宰相。
起初，內閣大學士只具有顧問身份，皇帝為最終決定的權力，而大學士很少有參決的機會。到明仁宗、明宣宗時期，大學士均因有太子經師的恩情，而得以累加至太子三孤身份，地位日益受尊崇。宣宗時期，朝廷事無大小，宣宗均悉數諮詢大學士楊士奇的看法而決定。
雖然吏部尚書蹇義、戶部尚書夏原吉召見時得以參與各部事宜，然而其還遠不如楊士奇等內閣成員得以親自接見。自此，內閣的權力日益增大，到明世宗中葉，夏言、嚴嵩等人執掌內閣，地位赫然為真正的宰相，亦可壓制六部。
5、六部
明朝中書省時期，七卿長官均為正三品。洪武十三年，朱元璋罷中書，仿《周官》六卿之制，升六部秩，各設尚書、侍郎一人。
六部包括吏部、戶部、禮部、兵部、刑部、工部，其所屬最高長官為明朝吏部尚書、明朝戶部尚書、明朝禮部尚書、明朝兵部尚書、明朝刑部尚書、明朝工部尚書，其常常與都察院之都御史、通政使司之通政使、大理寺之大理寺卿合稱“九卿”。
明朝時，重臣任擇須由九卿及外省巡撫、總督公開舉薦，此為廷推。各部司不能單獨決定的國家大事、要事，須經九卿公決，此為廷議。而由三法司無法決定的大型獄訟，以由九卿開會定獄，此為廷鞠或園審。其與明朝內閣構成了明朝的行政權力中心與決策核心。
1、宗人府
掌管明朝皇帝九族的宗族名冊，並按時撰寫帝王譜系，記錄宗室成員子女的嫡庶、名稱封號、嗣職襲位、生卒年間、婚嫁、喪葬諡號等事。凡是宗室陳述請求，均為之向皇上彙報，並引薦賢才、記錄得失等。明朝洪武三年，設立大宗正院。
洪武二十二年，改名宗人府，並命親王掌管，秦王朱樉為第一任宗人令。此後，均以元勳外戚大臣兼領，不再專設官員，其負責事務轉移至禮部。
2、三公
三公，即明朝的太師、太傅、太保三職的合稱，正一品。負責協助皇帝處理重要國事政務，職位至重。洪武三年，明太祖朱元璋授李善長為太師、徐達為太傅、常遇春為太保。建文年間，三公職位被撤。直到永樂二十年八月，明成祖朱棣再恢復三公職位，但無實授。
宣德三年，明宣宗授英國公張輔為太師，沐晟為太傅，陳懋為太保，當時三公官職，幾乎為專授。自宣德、正統年間以後，三公成為虛銜，為勳戚文武大臣加官、贈官。
3、中書省
明朝中書省，為明朝初期至洪武十三年（1380年）期間的行政中樞。其中丞相為明朝中書省的最高階長官，負責統領六部。明初沿襲元朝制度，設立中書省，置左、右丞相。甲辰正月，初置左、右相國，其中李善長為右相國，徐達為左相國。
吳元年，改右相國為左相國，左相國為右相國。洪武元年，改為左、右丞相。由中書省統六部，但不設定中書令。洪武十三年（1380年），胡惟庸案之後，明太祖朱元璋罷中書省，分中書省之權歸於六部。原中書省官屬盡革，惟存中書舍人。
4、明朝內閣
明朝內閣，為明成祖首先確立。乃是明朝建文四年（1402年）至崇禎十七年（1644年）的皇帝諮政機構，此後權力逐漸增大，後形成為明朝行政中樞。內閣輔臣的人數為一人至七人不等，輔臣奉使出外辦事，多自稱閣部。明太祖廢除宰相。
起初，內閣大學士只具有顧問身份，皇帝為最終決定的權力，而大學士很少有參決的機會。到明仁宗、明宣宗時期，大學士均因有太子經師的恩情，而得以累加至太子三孤身份，地位日益受尊崇。宣宗時期，朝廷事無大小，宣宗均悉數諮詢大學士楊士奇的看法而決定。
雖然吏部尚書蹇義、戶部尚書夏原吉召見時得以參與各部事宜，然而其還遠不如楊士奇等內閣成員得以親自接見。自此，內閣的權力日益增大，到明世宗中葉，夏言、嚴嵩等人執掌內閣，地位赫然為真正的宰相，亦可壓制六部。
5、六部
明朝中書省時期，七卿長官均為正三品。洪武十三年，朱元璋罷中書，仿《周官》六卿之制，升六部秩，各設尚書、侍郎一人。
六部包括吏部、戶部、禮部、兵部、刑部、工部，其所屬最高長官為明朝吏部尚書、明朝戶部尚書、明朝禮部尚書、明朝兵部尚書、明朝刑部尚書、明朝工部尚書，其常常與都察院之都御史、通政使司之通政使、大理寺之大理寺卿合稱“九卿”。
明朝時，重臣任擇須由九卿及外省巡撫、總督公開舉薦，此為廷推。各部司不能單獨決定的國家大事、要事，須經九卿公決，此為廷議。而由三法司無法決定的大型獄訟，以由九卿開會定獄，此為廷鞠或園審。其與明朝內閣構成了明朝的行政權力中心與決策核心。