ChromiumTM Single Cell 3′ Solution是基於10 X Genomics平臺，能夠一次性分離、並標記500–10000個單細胞，並能在單細胞水平進行檢測的技術，其透過微流控系統，將單細胞或長片段DNA分子快速分配到油包水的微反應體系中，每個微反應體系中的單DNA分子會獲得唯一的特異性分子標籤，製備生成的測序文庫可以在illumina平臺進行測序，並由10x Genomics提供資料分析及視覺化軟體，測序實驗及分析流程可以和illumina系統無縫銜接。該平臺廣泛應用於3’單細胞轉錄組測序、基因組組裝應用、免疫組庫測序、ATAC-seq、人全基因組及全外顯子組測序。

10x Genomics單細胞轉錄組測序有效地解決了組織樣本無法破解的細胞異質性難題，有助於發現新的細胞型別；並基於大量的單細胞基因表達資料，可以提供細胞表達特徵聚類、亞群表達特徵的分析、標誌物篩選等方面的分析，是一種高效的單細胞基因表達水平檢測技術。

10X GENOMICS單細胞轉錄組測序優缺點

10x Genomics單細胞轉錄組測序優點

1、簡單便捷：集單細胞分選、擴增、建庫於一體；

2、細胞通量高：每個樣本細胞數可達500-10000個；

3、建庫週期短：1天可完成細胞懸液製備、單細胞捕獲、擴增及建庫；

4、超高捕獲效率：單細胞捕獲效率高達65%；

5、真正意義的單細胞：單個液滴捕獲到多個細胞的機率極低（0.9%/1000cells）；

6、價格實惠：相較於其它單細胞平臺，價格實惠。

10x Genomics單細胞轉錄組測序缺點

1、非全長資訊：只能獲得3’端轉錄本資訊；

2、樣本要求高：單個樣本細胞起始量達10^5-10^6個，活細胞數目需超過80%，建議在90%以上最佳。