1到家後調整時間，媽媽會讓你去和博士打招呼

2去找副主角和博士發現沒人，村北出現狀況，去了發現博士遇難，讓你用他包裡的任何一隻來戰鬥幫他

3博士跟你回實驗室為了感謝你把剛剛用來戰鬥的那隻送給你，要你去103道路，副主角在那裡等你

4往北走透過101道路到村莊裡遇到個女的會告訴你商店的功能並送你治癒藥，再往北就是103道路，副主角就在那拿著剋制你的神奇寶貝等著你

5聊完後開始比賽。先練個功再打，打完後他就開心的要回去了，回去後博士會給你圖鑑，副主角給你寶貝球，回家後母親給你跑步鞋，按著B能跑步。

6再來就能自由捕捉了，圖鑑新功能這代是新開的圖鑑，編號從1開始.叫聲部分多了聲音的波型；另外多了大小比例功能，能知道她跟你比誰大誰小（好像和親密度也有些關係，距離遠近）附近還有No 012這種小動物請務必抓了之後帶著他 ，一段時間後他會莫名其妙的找到寶物後帶身上,我才剛開始就靠這個拿到奇蹟糖果。

7打完剛剛的男人會給一顆超級球，再來他會突然跑掉不理你，森林裡特多的蟲算是替代大針蜂和巴大蝴的一樣lv7跟lv10進化兩種好像是不能讓他學毒針影響進化種類(隱藏寶物 治療藥和寶貝球位置很明顯草叢中一個洞) 透過樹林後會到一個花房外面會拿到技能機和種子機槍， 裡面會拿到一個樹果和一把澆花用水壺。

9寶貝中心又上方的那間能神奇寶貝學校和老師聊天後能取得先制之爪，這邊的gym才是第一道場岩石系和以前一樣把蟲練到會念力或用(103道路有)(森林裡)就能輕鬆解決