按時間順序，暫排個十大吧:

1，孝莊下嫁之謎。下嫁攝政王多爾袞，是不是為了兒子福臨？

2，順治落髮？還是死於天花？

順治皇帝到底是落髮到了五臺山，還是真的病死了。不過落髮五臺山更得史學界的支援

3.雍正帝即位之謎

雍正是清史上較有建樹的皇帝，可一直以來，雍正篡改詔書被廣為傳說。但這些年，都認為是康熙的傳位，根據是傳位詔書是用漢、滿兩種文字一起寫的。

4.雍正的逝世之謎

雍正皇帝的即位是個迷，其逝世也是個迷，到底是被刺殺而死？還是吃丹藥而死？還是積勞成疾，爆病而亡？

5.乾隆帝的身世之謎

乾隆的身世始終是個謎，到底是滿人所生還是漢女李氏所生，更有甚者是不是陳閣老之子也在爭辯之中。

6.香妃之謎

乾隆的妃子香妃，是一個充溢疑團的人，稱號“香妃”是個迷，其畫像是迷，葬地是迷，逝世也是個迷。

7.嘉慶帝遇刺案

嘉慶皇帝遇刺的確是實史，嘉慶皇帝在從神武門回宮時，遇一大漢行刺，但是禁宮以內，哪來的大漢？為何沒有被發現？因何行刺？皆是疑團。

8.天理教攻入皇宮

天理教是天地會的一支，活潑於北方，天理教起義雖然有宮內宦官相助，可是一舉攻入皇宮的，這卻是漢唐以來從未有過。

9.慈安太后暴病之謎

與慈禧太后並排掌權的慈安太后，為何會突然患病？而且一病不起，使得大權落入慈禧一人手中。

10.同治、光緒皇帝逝世之謎

同治與光緒均是壯年而死，不過他們的死是因病還是？

據我所知，清朝的著名疑案有：

1、孝莊太后下嫁案

2、順治帝出家案

3、雍正帝繼位案

4、雍正帝之死案

5、乾隆帝與海寧陳氏關係之謎

6、香妃之謎

7、嘉慶帝遇刺案

8、天理教攻入皇宮案

9、慈安太后暴死案

10、同治帝之死案

11、光緒帝之死案

這些宮廷疑案都曾經在社會上廣泛流傳，具有較大的影響。