在美國的一個高度機密的軍事實驗室中，故事主要講述，在一個頂級機密的軍事實驗室裡，一群智力超群的年輕科學家偶然間揭開了人體隱形的秘密。

他們以動物作實驗獲得了成功之後，Caine平日裡驕傲自大，一意孤行。這次不顧生命安危和同事的勸阻，執意要拿自己的身體做試驗品。小組成員成功地將塞巴斯蒂安變成透明人，但卻不能再將他恢復原形。於是大家決定一定要找到揭開這個難題的解藥“。然而，塞巴斯蒂安已經漸漸對自己隱形所帶來的前所未有的能力而陶醉不已，他可以為所欲為而不被別人發現。他開始覺他的同事們正在做的挽救他的工作是對他的威脅，他已經失去了人性的理智……當同事們成功將他變成隱形人後，卻發現不能將他還原。正當同事們為找到還原方法沒日沒夜工作時，Sebastian的身體和思想卻發生了他們意想不到的變化。他越來越覺得隱形人好處多多，不願意再回到從前的自我。他開始覺得同事們是破壞他隱形狀態的最大威脅。透明人幾乎可以說是把人類長期以來的夢想付諸於實現的電影，但是當人類擁有隱形的異能時，潛伏在人性底層的邪惡因子也開始作祟，舞弄權力的壞念頭使人掉入慾望的深淵而無法自拔，這也是《透明人》在驚悚片的特技包裝下，想探討的深層人性主題。而曾經主演過《驚濤駭浪》《家有跳狗》的男星凱文貝肯，則在《第六感追緝令》大導演保羅範赫文的包裝下，成了藉著隱形而一步步實現許多野心的瘋狂科學家。導演保羅範赫文坦承，電影最困難的部份其實就是如何將透明人變得更真實，比較起來，這部電影的特效其實就有些類似之前他執導的《星艦戰將》，就是在後斯製作過程中利用電腦動畫加上原本沒有的畫面，而《透明人》也是如此，但是在大銀幕前除了要呈現男主角面板和肌肉逐漸消失的真實感外，還得讓觀眾能感受到一個看不到的物體帶來的恐懼感。保羅範赫文同時指出，主角的權利慾望其實是他最讓人害怕的地方，不過凱文的娃娃臉，是他當初挑他當男主角的原因，因為他的長像非常的符合導演保羅的胃口，也適合演此片主角。