佩恩就是長門。
長門三人長大後以彌彥為首創立了曉，當時的雨隱之村首領半藏受到志村團藏的蠱惑，害怕他們勢力的擴大會威脅到自己的統治地位，所以半藏欺騙他們說，想借用他們的力量，向火、風、土三大國提出和平的交涉提案（因為雨隱之村處在三大國的交接處，戰略地位非常重要，而且當時第三次忍界大戰十分激烈），彌彥答應了他的請求。
但是他們到了會談的地點，才發現這是個圈套，半藏勾結團藏，在會談地點埋伏，參與抹殺他們三個的還有木葉的暗部。半藏以事先擒獲的小南的性命作要挾讓長門殺了彌彥，彌彥為了救小南讓長門殺了自己。
在不知如何選擇之時，彌彥撞到了長門的苦無上，倒在了長門身旁。就當半藏要將他們全部殺死的時候，長門擋住了半藏的手下的所有攻擊，然後救下小南，雙腿中了半藏的火遁·起爆炎陣。眼見遭受欺騙，摯友又死在自己面前，在極度憤怒之下使用輪迴眼召喚出外道魔像，震驚了全場所有人。之後木葉的暗部和半藏的手下都被外道魔像抽取靈魂，半藏、團藏落荒而逃。
彌彥死後，長門成為了曉的首領，並使用輪迴眼製出了屍體傀儡佩恩六道，彌彥的遺體被長門製作成為佩恩六道之中的天道佩恩，用來統率曉組織。後來，半藏被長門控制的佩恩六道所殺，從此長門支配了雨隱之村。
擴充套件資料：
過程在第393集（佩恩誕生） ——
劇情簡介：歷盡艱辛長門、小南和彌彥終於和自來也相遇了，自來也決定留下來照顧他們，於是四人生活就這樣開始了。直到有一天，長門為了保護彌彥用輪迴眼殺死了一名忍者，自此，自來也開始傳授給彌彥、小南和長門忍術。
三年後，自來也將和平的信念託付給了長門後離開了。於是他們以彌彥為首領開始行動，不依賴權利和武力去創造和平的想法很快得到了大家的支援，但是雨隱的首領卻利用卑鄙的手段殺害了彌彥。彌彥死後，長門代替彌彥成為了組織的首領，為了他們的目標，組織的成員接二連三的死去了，長門認為只要人存在，憎恨是不會消除的，自來也的想法根本就不切實際。
在聽完長門的故事，鳴人表示雖然理解長門的行為可還是無法原諒他的罪過。不過，自己是自來也的徒弟，自來也將希望寄託於他的身上，他就要相信自來也所相信的東西。得知站在他面前的人名叫鳴人，看到鳴人的決心，長門做了一個令人震驚的決定.....
佩恩就是長門。
長門三人長大後以彌彥為首創立了曉，當時的雨隱之村首領半藏受到志村團藏的蠱惑，害怕他們勢力的擴大會威脅到自己的統治地位，所以半藏欺騙他們說，想借用他們的力量，向火、風、土三大國提出和平的交涉提案（因為雨隱之村處在三大國的交接處，戰略地位非常重要，而且當時第三次忍界大戰十分激烈），彌彥答應了他的請求。
但是他們到了會談的地點，才發現這是個圈套，半藏勾結團藏，在會談地點埋伏，參與抹殺他們三個的還有木葉的暗部。半藏以事先擒獲的小南的性命作要挾讓長門殺了彌彥，彌彥為了救小南讓長門殺了自己。
在不知如何選擇之時，彌彥撞到了長門的苦無上，倒在了長門身旁。就當半藏要將他們全部殺死的時候，長門擋住了半藏的手下的所有攻擊，然後救下小南，雙腿中了半藏的火遁·起爆炎陣。眼見遭受欺騙，摯友又死在自己面前，在極度憤怒之下使用輪迴眼召喚出外道魔像，震驚了全場所有人。之後木葉的暗部和半藏的手下都被外道魔像抽取靈魂，半藏、團藏落荒而逃。
彌彥死後，長門成為了曉的首領，並使用輪迴眼製出了屍體傀儡佩恩六道，彌彥的遺體被長門製作成為佩恩六道之中的天道佩恩，用來統率曉組織。後來，半藏被長門控制的佩恩六道所殺，從此長門支配了雨隱之村。
擴充套件資料：
過程在第393集（佩恩誕生） ——
劇情簡介：歷盡艱辛長門、小南和彌彥終於和自來也相遇了，自來也決定留下來照顧他們，於是四人生活就這樣開始了。直到有一天，長門為了保護彌彥用輪迴眼殺死了一名忍者，自此，自來也開始傳授給彌彥、小南和長門忍術。
三年後，自來也將和平的信念託付給了長門後離開了。於是他們以彌彥為首領開始行動，不依賴權利和武力去創造和平的想法很快得到了大家的支援，但是雨隱的首領卻利用卑鄙的手段殺害了彌彥。彌彥死後，長門代替彌彥成為了組織的首領，為了他們的目標，組織的成員接二連三的死去了，長門認為只要人存在，憎恨是不會消除的，自來也的想法根本就不切實際。
在聽完長門的故事，鳴人表示雖然理解長門的行為可還是無法原諒他的罪過。不過，自己是自來也的徒弟，自來也將希望寄託於他的身上，他就要相信自來也所相信的東西。得知站在他面前的人名叫鳴人，看到鳴人的決心，長門做了一個令人震驚的決定.....