1、第001話 雲霄飛車殺人事件 高中生偵探工藤新一被稱為“日本警察界的救世主”而響譽全國，他幫助警方解決了很多棘手案件。 某日，他和青梅竹馬小蘭一起去坐雲霄飛車時遇到了一起因情生恨兇殺事件，其中，有兩名黑衣人引起了工藤的注意，工藤暗中跟蹤卻被發現，黑衣給他灌下毒藥後離開，當被警察發現時，工藤已變成了小孩兒的模樣。
2、第050話 外交官殺人事件(下集) 小蘭找來醫生時，卻發現柯南不見了，她四處尋找來到了犯罪現場，而服部已經開始了對兇手的指認，兇手就是死者的父親利光，他本人也主動承認。 這時，工藤新一出現，他推翻了服部的推測，並對兇手重新指認，服部甘願認輸，警方帶走兇手後，工藤因心痛難耐顧不上和小蘭說句話就躲了起來變回柯南，休息了三天後，他意識到老白乾是讓他恢復原形的方法。
3、第172話 飛天密室 小蘭在去沖繩旅行的飛機上想起了一年前新一在飛機上首次處理命案的事情，當時正值深夜，飛機上所有的人都在睡覺，突然傳來一聲尖叫，一名叫大鷹的男子在廁所被人殺害。 碰巧目暮警官也在飛機上，於是新一和目暮警官一起對機艙上所有可疑的人進行了調查，在尋找兇器無果後，新一想到兇器一定就在兇手身上。
4、第173話 飛天密室 新一要求在次對嫌犯的物品進行搜查，可依舊沒有發現可疑物品，之後，新一在鷺沼的座位上發現了底片的碎片，並將所有人的證詞、座位上的底片、牆壁上的血漬和被害人口袋被弄溼都串成了一線，雖然鷺沼的嫌疑最大，但新一卻說兇手不是他，因為他被真兇所利用，推理一步步接近真相。
5、第536話 服部平次vs工藤新一 平次和柯南打電話的時候，講起了自己在初中時期遇到的一個未曾謀面的勁敵。當時，平次和同學們一起來山裡滑雪，不想遇見一起命案，而死者正是著名演員箕輪獎兵，這起案件與四年前曾在這裡發生過的命案極其相似，受害者都是死在纜車上並且身邊的揹包裡全是雪。 在調查過程中，服部總會從別人口中聽到一個同樣參與破案的初中生，而這個人正是工藤新一，服部不由和這個“隱形”對手較起了勁。
1、第001話 雲霄飛車殺人事件 高中生偵探工藤新一被稱為“日本警察界的救世主”而響譽全國，他幫助警方解決了很多棘手案件。 某日，他和青梅竹馬小蘭一起去坐雲霄飛車時遇到了一起因情生恨兇殺事件，其中，有兩名黑衣人引起了工藤的注意，工藤暗中跟蹤卻被發現，黑衣給他灌下毒藥後離開，當被警察發現時，工藤已變成了小孩兒的模樣。
2、第050話 外交官殺人事件(下集) 小蘭找來醫生時，卻發現柯南不見了，她四處尋找來到了犯罪現場，而服部已經開始了對兇手的指認，兇手就是死者的父親利光，他本人也主動承認。 這時，工藤新一出現，他推翻了服部的推測，並對兇手重新指認，服部甘願認輸，警方帶走兇手後，工藤因心痛難耐顧不上和小蘭說句話就躲了起來變回柯南，休息了三天後，他意識到老白乾是讓他恢復原形的方法。
3、第172話 飛天密室 小蘭在去沖繩旅行的飛機上想起了一年前新一在飛機上首次處理命案的事情，當時正值深夜，飛機上所有的人都在睡覺，突然傳來一聲尖叫，一名叫大鷹的男子在廁所被人殺害。 碰巧目暮警官也在飛機上，於是新一和目暮警官一起對機艙上所有可疑的人進行了調查，在尋找兇器無果後，新一想到兇器一定就在兇手身上。
4、第173話 飛天密室 新一要求在次對嫌犯的物品進行搜查，可依舊沒有發現可疑物品，之後，新一在鷺沼的座位上發現了底片的碎片，並將所有人的證詞、座位上的底片、牆壁上的血漬和被害人口袋被弄溼都串成了一線，雖然鷺沼的嫌疑最大，但新一卻說兇手不是他，因為他被真兇所利用，推理一步步接近真相。
5、第536話 服部平次vs工藤新一 平次和柯南打電話的時候，講起了自己在初中時期遇到的一個未曾謀面的勁敵。當時，平次和同學們一起來山裡滑雪，不想遇見一起命案，而死者正是著名演員箕輪獎兵，這起案件與四年前曾在這裡發生過的命案極其相似，受害者都是死在纜車上並且身邊的揹包裡全是雪。 在調查過程中，服部總會從別人口中聽到一個同樣參與破案的初中生，而這個人正是工藤新一，服部不由和這個“隱形”對手較起了勁。