形而上學的第三部分就是宇宙論，探討世界，世界的偶然性、必然性、永恆性、在時空中的限制，世界在變化中的形式的規律，以及人類的自由和惡的起源。 　　宇宙論是研究宇宙的大尺度結構和演化的學科。當我們巡視遙遠的太空深處時，也就是在沿著時間上溯。我們所看到的那些最遠的星系，是很久很久以前當它們發出的光開始其漫長的太空旅行時的面貌。既然龐大的星系都曾經是年輕的，所以宇宙結構如何產生的問題就同宇宙論不可分割地聯絡在一起。研究宇宙中可觀測的結構（從巨大的星系團到太陽系）的起源屬於天體演化學的領域。有待查明的根本問題包括：宇宙是何時和怎樣發端的，星系是如何形成並獲得我們觀測到的形態及尺度分佈的，恆星是如何誕生的，行星和生命是如何演化的，等等。 本體論就是以本體為研究物件的學問，又譯“存在論” 形而上學的物件“實體”雖然與本體有著細微的差別，但作為根本的存在，一般也可譯為“本體”。 本體論和理性神學、理性宇宙論、理性心理學被當做是形而上學的分支。 形而上學的物件是實體。實體是什麼？不同的形而上學家們對它有不同的回答。在數量上， 有人認為實體只有一個（如斯賓諾莎），有人則認為有多個（如萊布尼茨）；在性質上，有人 認為實體是精神的（如萊布尼茨），有人認為實體是物質的（如斯賓諾莎），也有人認為它既 有精神的，也有物質的（如笛卡爾）；在涉及上帝方面，有人認為上帝是超越其他實體的絕對 實體（如笛卡爾、托馬斯），也有人認為神性體現在自然實體之中，因而自然實體就是上帝 （如斯賓諾莎）。 但是，儘管形而上學家們對實體的看法千差萬別，可從整體上看，我們可以說，一般形而上 學所謂的實體主要有：上帝、物質實體和精神實體。不過，由於形而上學家存在著一元論和 多元論的差別，也由於形而上學家存在著唯物論、唯心論、甚至有的是宗教哲學家的差別， 所以，作為形而上學整體的實體物件，在每一個不同的形而上學家那裡呈現出千姿百態的形 式。