第一系：
1、神武天皇前660年2月11日—前585年3月11日 在位75年（日本史上首任天皇，傳為天照大神的後裔。）
2、綏靖天皇前585年11月8日—前549年5月10日 在位36年（由綏靖天皇到開化天皇共八代，歷史上只有誕生、即位、以及建宮、立後等記載，沒有治績紀錄，故在日本歷史上稱作闕史八代。）
3、安寧天皇前549年7月3日—前511年12月6日 在位38年（闕史八代，一說安寧天皇元年為前548年。）
4、懿德天皇前510年2月4日—前477年9月18日 在位33年（闕史八代。）
5、孝昭天皇前476年1月9日—前393年8月5日 在位83年（闕史八代。）
6、孝安天皇前392年1月7日—前291年1月9日 在位101年（闕史八代。）
7、孝靈天皇前291年1月12日—前215年2月8日 在位76年（闕史八代。）
8、孝元天皇 前215年11月14日—前158年9月2日 在位57年（闕史八代。）
9、開化天皇前158年11月12日—前98年4月9日 在位60年（闕史八代，一說開化天皇元年為前157年。）
10、崇神天皇前98年7月13日—前30年12月5日 在位68年（首位在考古學上可考證的天皇。）
11、垂仁天皇前29年1月2日—公元70年7月14日 在位98年（廢除殉禮。）
12、景行天皇71年7月11日—130年11月7日 在位59年（日本武尊東征。）
13、成務天皇131年1月5日—190年6月11日 在位59年（劃分國、縣、邑等地方行政區域。）
14、仲哀天皇190年11月11日—200年2月6日 在位10年（日本武尊之子，違逆神旨而死。）
15、應神天皇200年1月1日—310年2月15日 在位110年（一說即傳說中的八幡大神（八幡大菩薩）。）
16、仁德天皇310年11月3日—399年1月16日 在位89年（聖帝之世。）
17、履中天皇）400年2月1日—405年3月15日 在位5年（命諸國設定國史，但現已亡佚。）
18、反正天皇406年1月2日—410年1月23日 在位5年（平定仲皇子之亂。）
19、允恭天皇410年12月—453年1月14日 在位43年
20、安康天皇453年12月14日—456年8月9日 在位3年（與輕皇子爭位勝出。）
21、雄略天皇456年11月13日—479年8月7日 在位23年（暴君說。）
22、清寧天皇480年1月15日—484年1月16日 在位4年
23、顯宗天皇485年1月1日—487年4月25日 在位2年（市邊押磐皇子遺兒。）
24、仁賢天皇488年1月5日—498年8月8日 在位10年（報德不報怨。）
25、武烈天皇498年12月—506年12月8日 在位8年（殘暴不仁的天皇，仁德帝一脈終絕。）
26、繼體天皇507年2月4日—531年2月7日 在位24年（應神天皇五代孫，第一位早期天皇。）
27、安閒天皇531年2月7日—535年12月17日 在位4年
28、宣化天皇535年12月—539年2月10日在位4年
29、欽明天皇539年12月5日—571年4月 在位32年（崇佛廢佛論爭展開。）
30、敏達天皇572年4月3日—585年8月15日在位13年
31、用明天皇585年9月5日—587年4月9日在位2年（聖德太子之父。）
32、崇峻天皇587年8月2日—592年11月3日在位5年（崇佛廢佛論爭完結，崇佛派蘇我馬子獲勝並暗殺天皇，佛教地位奠定。）
33、推古天皇592年12月8日—628年3月7日在位36年（日本歷史上首位女天皇。）
注： 推古二年（593年）至推古三十年（622年）由聖德太子攝政。
第二系：
34、舒明天皇629年1月4日—641年10月9日 在位12年
35、皇極天皇642年1月15日—645年6月14日 在位3年（女天皇。）
36、孝德天皇645年6月14日—654年10月10日 在位9年（645年定年號為大化，創日本年號之始。推行大化革新，指定官制。）
37、齊明天皇645年1月3日—661年7月24日 在位16年（即皇極天皇，於孝德天皇死後重祚。）
38、天智天皇661年7月24日—671年12月3日 在位10年（天皇制確立。）
39、弘文天皇671年12月5日—672年7月23日 在位1年（即位紀錄於正史中被抹煞，又稱大友帝。明治3年追贈諡號。）
40、天武天皇673年2月27日—686年9月9日 在位13年（強化天皇中央集權制。）
41、持統天皇686年9月9日—697年8月1日 在位11年（天武帝皇后，女天皇。）
42、文武天皇697年8月1日—707年6月15日 在位10年（命藤原不比等等人編法典《大寶律令》，設定鑄錢司。）
43、元明天皇707年7月17日—715年9月2日 在位8年（女天皇。）
44、元正天皇715年9月2日—724年2月4日 在位9年（女天皇。）
45、聖武天皇724年2月4日—749年7月2日 在位25年（設立東大寺。）
46、孝謙天皇749年7月2日—758年8月1日 在位9年（女天皇。）
47、淳仁天皇758年8月1日—764年10月9日 在位6年（又稱“淡路廢帝”，明治維新後追贈淳仁之諡號。）
48、稱德天皇764年10月9日—770年8月4日 在位6年（孝謙天皇重祚，與僧道鏡有染。）
49、光仁天皇770年10月1日—781年4月3日 在位11年（天智系一脈。）
50、桓武天皇781年4月3日—806年3月17日 在位25年（異稱“柏原天皇”，遷都平安京，開創平安時代。）
51、平城天皇806年3月17日—809年4月1日 在位3年（異稱“奈良天皇”，下令遷回舊都平城京，引發藥子之變；追號根據其所住宮殿的地名。）
52、嵯峨天皇809年4月1日—823年4月16日 在位14年（和文全盛期，允文允武。追號根據其讓位後的住所。）
53、淳和天皇823年4月16日—833年2月28日 在位10年（又稱“西院之帝”。追號根據其讓位後的住所。）
54、仁明天皇833年2月28日—850年3月21日 在位17年（異稱“深草天皇”，發生承和之變。）
55、文德天皇850年3月21日—858年8月27日 在位8年
56、清和天皇858年11月7日—876年11月29日 在位18年（追號根據其讓位後的住所。）
57、陽成天皇876年11月29日—884年2月4日 在位8年（陽狂之帝。追號根據其讓位後的住所。）
58、光孝天皇884年2月5日—887年8月26日 在位3年（異稱“小松帝”。）
59、宇多天皇887年8月26日—897年7月3日 在位10年（臣籍降下，之後恢復皇籍即位；追號根據其讓位後的住所。）
60、醍醐天皇897年7月3日—930年9月22日 在位33年（出生時為臣籍，恢復皇籍後即位，編纂古今集，追號根據其山陵之名。）
61、朱雀天皇930年9月22日—946年4月20日 在位16年（將門、純友之亂；追號根據其讓位後的住所。）
62、村上天皇946年4月20日—967年5月25日 在位21年（追號根據其讓位後的住所。）
63、冷泉天皇967年5月25日—969年8月13日 在位2年（追號根據其讓位後的住所。）
64、圓融天皇969年8月13日—984年8月27日 在位15年（追號根據其住所（寺名、庵號）。）
65、花山天皇984年8月27日—986年6月23日 在位2年（追號根據其住所（寺名、庵號）。）
66、一條天皇986年6月23日—1011年6月13日 在位25年（追號根據其在位時的皇居的宮名。）
注： 第37代齊明天皇為第35代皇極天皇重新登基後的稱號，因此她們是同一人；同樣，第46代孝謙天皇與第48代稱德天皇也是同一人。
第一系：
1、神武天皇前660年2月11日—前585年3月11日 在位75年（日本史上首任天皇，傳為天照大神的後裔。）
2、綏靖天皇前585年11月8日—前549年5月10日 在位36年（由綏靖天皇到開化天皇共八代，歷史上只有誕生、即位、以及建宮、立後等記載，沒有治績紀錄，故在日本歷史上稱作闕史八代。）
3、安寧天皇前549年7月3日—前511年12月6日 在位38年（闕史八代，一說安寧天皇元年為前548年。）
4、懿德天皇前510年2月4日—前477年9月18日 在位33年（闕史八代。）
5、孝昭天皇前476年1月9日—前393年8月5日 在位83年（闕史八代。）
6、孝安天皇前392年1月7日—前291年1月9日 在位101年（闕史八代。）
7、孝靈天皇前291年1月12日—前215年2月8日 在位76年（闕史八代。）
8、孝元天皇 前215年11月14日—前158年9月2日 在位57年（闕史八代。）
9、開化天皇前158年11月12日—前98年4月9日 在位60年（闕史八代，一說開化天皇元年為前157年。）
10、崇神天皇前98年7月13日—前30年12月5日 在位68年（首位在考古學上可考證的天皇。）
11、垂仁天皇前29年1月2日—公元70年7月14日 在位98年（廢除殉禮。）
12、景行天皇71年7月11日—130年11月7日 在位59年（日本武尊東征。）
13、成務天皇131年1月5日—190年6月11日 在位59年（劃分國、縣、邑等地方行政區域。）
14、仲哀天皇190年11月11日—200年2月6日 在位10年（日本武尊之子，違逆神旨而死。）
15、應神天皇200年1月1日—310年2月15日 在位110年（一說即傳說中的八幡大神（八幡大菩薩）。）
16、仁德天皇310年11月3日—399年1月16日 在位89年（聖帝之世。）
17、履中天皇）400年2月1日—405年3月15日 在位5年（命諸國設定國史，但現已亡佚。）
18、反正天皇406年1月2日—410年1月23日 在位5年（平定仲皇子之亂。）
19、允恭天皇410年12月—453年1月14日 在位43年
20、安康天皇453年12月14日—456年8月9日 在位3年（與輕皇子爭位勝出。）
21、雄略天皇456年11月13日—479年8月7日 在位23年（暴君說。）
22、清寧天皇480年1月15日—484年1月16日 在位4年
23、顯宗天皇485年1月1日—487年4月25日 在位2年（市邊押磐皇子遺兒。）
24、仁賢天皇488年1月5日—498年8月8日 在位10年（報德不報怨。）
25、武烈天皇498年12月—506年12月8日 在位8年（殘暴不仁的天皇，仁德帝一脈終絕。）
26、繼體天皇507年2月4日—531年2月7日 在位24年（應神天皇五代孫，第一位早期天皇。）
27、安閒天皇531年2月7日—535年12月17日 在位4年
28、宣化天皇535年12月—539年2月10日在位4年
29、欽明天皇539年12月5日—571年4月 在位32年（崇佛廢佛論爭展開。）
30、敏達天皇572年4月3日—585年8月15日在位13年
31、用明天皇585年9月5日—587年4月9日在位2年（聖德太子之父。）
32、崇峻天皇587年8月2日—592年11月3日在位5年（崇佛廢佛論爭完結，崇佛派蘇我馬子獲勝並暗殺天皇，佛教地位奠定。）
33、推古天皇592年12月8日—628年3月7日在位36年（日本歷史上首位女天皇。）
注： 推古二年（593年）至推古三十年（622年）由聖德太子攝政。
第二系：
34、舒明天皇629年1月4日—641年10月9日 在位12年
35、皇極天皇642年1月15日—645年6月14日 在位3年（女天皇。）
36、孝德天皇645年6月14日—654年10月10日 在位9年（645年定年號為大化，創日本年號之始。推行大化革新，指定官制。）
37、齊明天皇645年1月3日—661年7月24日 在位16年（即皇極天皇，於孝德天皇死後重祚。）
38、天智天皇661年7月24日—671年12月3日 在位10年（天皇制確立。）
39、弘文天皇671年12月5日—672年7月23日 在位1年（即位紀錄於正史中被抹煞，又稱大友帝。明治3年追贈諡號。）
40、天武天皇673年2月27日—686年9月9日 在位13年（強化天皇中央集權制。）
41、持統天皇686年9月9日—697年8月1日 在位11年（天武帝皇后，女天皇。）
42、文武天皇697年8月1日—707年6月15日 在位10年（命藤原不比等等人編法典《大寶律令》，設定鑄錢司。）
43、元明天皇707年7月17日—715年9月2日 在位8年（女天皇。）
44、元正天皇715年9月2日—724年2月4日 在位9年（女天皇。）
45、聖武天皇724年2月4日—749年7月2日 在位25年（設立東大寺。）
46、孝謙天皇749年7月2日—758年8月1日 在位9年（女天皇。）
47、淳仁天皇758年8月1日—764年10月9日 在位6年（又稱“淡路廢帝”，明治維新後追贈淳仁之諡號。）
48、稱德天皇764年10月9日—770年8月4日 在位6年（孝謙天皇重祚，與僧道鏡有染。）
49、光仁天皇770年10月1日—781年4月3日 在位11年（天智系一脈。）
50、桓武天皇781年4月3日—806年3月17日 在位25年（異稱“柏原天皇”，遷都平安京，開創平安時代。）
51、平城天皇806年3月17日—809年4月1日 在位3年（異稱“奈良天皇”，下令遷回舊都平城京，引發藥子之變；追號根據其所住宮殿的地名。）
52、嵯峨天皇809年4月1日—823年4月16日 在位14年（和文全盛期，允文允武。追號根據其讓位後的住所。）
53、淳和天皇823年4月16日—833年2月28日 在位10年（又稱“西院之帝”。追號根據其讓位後的住所。）
54、仁明天皇833年2月28日—850年3月21日 在位17年（異稱“深草天皇”，發生承和之變。）
55、文德天皇850年3月21日—858年8月27日 在位8年
56、清和天皇858年11月7日—876年11月29日 在位18年（追號根據其讓位後的住所。）
57、陽成天皇876年11月29日—884年2月4日 在位8年（陽狂之帝。追號根據其讓位後的住所。）
58、光孝天皇884年2月5日—887年8月26日 在位3年（異稱“小松帝”。）
59、宇多天皇887年8月26日—897年7月3日 在位10年（臣籍降下，之後恢復皇籍即位；追號根據其讓位後的住所。）
60、醍醐天皇897年7月3日—930年9月22日 在位33年（出生時為臣籍，恢復皇籍後即位，編纂古今集，追號根據其山陵之名。）
61、朱雀天皇930年9月22日—946年4月20日 在位16年（將門、純友之亂；追號根據其讓位後的住所。）
62、村上天皇946年4月20日—967年5月25日 在位21年（追號根據其讓位後的住所。）
63、冷泉天皇967年5月25日—969年8月13日 在位2年（追號根據其讓位後的住所。）
64、圓融天皇969年8月13日—984年8月27日 在位15年（追號根據其住所（寺名、庵號）。）
65、花山天皇984年8月27日—986年6月23日 在位2年（追號根據其住所（寺名、庵號）。）
66、一條天皇986年6月23日—1011年6月13日 在位25年（追號根據其在位時的皇居的宮名。）
注： 第37代齊明天皇為第35代皇極天皇重新登基後的稱號，因此她們是同一人；同樣，第46代孝謙天皇與第48代稱德天皇也是同一人。