一、常現生物：

1．細菌：原核類：具細胞結構，但細胞內無核膜和核仁的分化，也無複雜的細胞器，包括：細菌（桿狀、球狀、螺旋狀）、放線菌、藍細菌、支原體、衣原體、立克次氏體、螺旋體。

①細菌：三冊書中所涉及的所有細菌的種類：

乳酸菌、硝化細菌（代謝型別）；

肺炎雙球菌S型、R型（遺傳的物質基礎）；

結核桿菌和麻風桿菌（胞內寄生菌）；

根瘤菌、圓褐固氮菌（固氮菌）；

大腸桿菌、枯草桿菌、土壤農桿菌（為基因工程提供運載體，也可作為基因工程的受體細胞）；

蘇雲金芽孢桿菌（為抗蟲棉提供抗蟲基因）；

假單孢桿菌（分解石油的超級細菌）；

甲基營養細菌、穀氨酸棒狀桿菌、黃色短桿菌（微生物的代謝）；

鏈球菌（一般厭氧型）；

產甲烷桿菌（嚴格厭氧型）等

②放線菌：是主要的抗生素產生菌。它們產生鏈黴素、慶大黴素、紅黴素、四環素、環絲氨酸、多氧黴素、環已醯胺、氯黴素和磷黴素等種類繁多的抗生素（85%）。繁殖方式為分生孢子繁殖。

2．病毒：病毒類：無細胞結構，主要由蛋白質和核酸組成，包括病毒和亞病毒（類病毒、擬病毒、朊病毒）① 動物病毒：RNA類（脊髓灰質炎病毒、狂犬病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒、流感病毒、艾滋病病毒、口蹄疫病毒、腦膜炎病毒、SARS病毒）

DNA類（痘病毒、腺病毒、皰疹病毒、虹彩病毒、乙肝病毒）

②植物病毒：RNA類（菸草花葉病毒、馬鈴薯X病毒、黃瓜花葉病毒、大麥黃化病毒等）

3．真核類：具有複雜的細胞器和成形的細胞核，包括：酵母菌、黴菌（絲狀真菌）、蕈菌（大型真菌）等真菌及單細胞藻類、原生動物（大草履蟲、小草履蟲、變形蟲、間日瘧原蟲等）等真核微生物。

① 黴菌：可用於發酵上工業，廣泛的用於生產酒精、檸檬酸、甘油、酶製劑（如蛋白酶、澱粉酶、纖維素酶等）、固醇、維生素等。在農業上可用於飼料發酵、生產植物生長素（如赤酶黴素）、殺蟲農藥（如白僵菌劑）、除草劑等。危害如可使食物黴變、產生毒素（如黃麴黴毒素具致癌作用、鐮孢菌毒素可能與克山病有關）。常見黴菌主要有毛黴、根黴、麴黴、青黴、赤黴菌、白僵菌、脈胞菌、木黴等。

4．微生物代謝型別：

① 光能自養：光合細菌、藍細菌（水作為氫供體）紫硫細菌、綠硫細菌（H2S作為氫供體，嚴格厭氧）2H2S＋CO2 [CH2O]＋H2O＋2S

② 光能異養：以光為能源，以有機物（甲酸、乙酸、丁酸、甲醇、異丙醇、丙酮酸、和乳酸）為碳源與氫供體營光合生長。Sunny細菌利用丙酮酸與乳酸用為唯一碳源光合生長。

④ 化能異養：寄生、腐生細菌。

⑤ 好氧細菌：硝化細菌、穀氨酸棒狀桿菌、黃色短桿菌等

⑥ 厭氧細菌：乳酸菌、破傷風桿菌等

⑦ 中間型別：紅螺菌（光能自養、化能異養、厭氧[兼性光能營養型]）、氫單胞菌（化能自養、化能異養[兼性自養]）、酵母菌（需氧、厭氧[兼性厭氧型]）